More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5646 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  60.82 
 
 		 603 aa  726    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  53 
 
 		 596 aa  644    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  60.89 
 
 		 602 aa  710    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  57.41 
 
 		 625 aa  682    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  59.59 
 
 		 619 aa  673    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  56.68 
 
 		 601 aa  655    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  62.8 
 
 		 591 aa  739    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  54.68 
 
 		 596 aa  678    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  100 
 
 		 596 aa  1189    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  59.16 
 
 		 601 aa  735    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  53.22 
 
 		 596 aa  653    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  58.66 
 
 		 601 aa  731    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  58.39 
 
 		 595 aa  684    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  51.44 
 
 		 590 aa  635    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  52.63 
 
 		 596 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  61.05 
 
 		 601 aa  746    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  50.76 
 
 		 590 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  51.1 
 
 		 590 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  50.93 
 
 		 590 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  55.99 
 
 		 620 aa  610  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  46.69 
 
 		 595 aa  544  1e-153  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  42.3 
 
 		 650 aa  476  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  43.6 
 
 		 660 aa  476  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  45.28 
 
 		 644 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  43.19 
 
 		 648 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  42.88 
 
 		 638 aa  451  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  40.23 
 
 		 651 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  39.97 
 
 		 639 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3603  ABC transporter related  42.98 
 
 		 962 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0813652  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  43.89 
 
 		 658 aa  426  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3174  ABC transporter related  42.02 
 
 		 750 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  39.1 
 
 		 629 aa  405  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0913  ABC transporter related  39.71 
 
 		 678 aa  402  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00146704 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4137  ABC transporter related protein  36.54 
 
 		 718 aa  397  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  38.53 
 
 		 585 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 575 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  39.97 
 
 		 589 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.14 
 
 		 571 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.14 
 
 		 571 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.14 
 
 		 571 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.97 
 
 		 571 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  33.97 
 
 		 571 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.31 
 
 		 571 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.97 
 
 		 571 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.14 
 
 		 571 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  33.97 
 
 		 571 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.97 
 
 		 571 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  36.99 
 
 		 568 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  36.79 
 
 		 579 aa  362  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  33.05 
 
 		 600 aa  360  5e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  35.84 
 
 		 594 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  38.65 
 
 		 581 aa  358  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  37.52 
 
 		 584 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  36.8 
 
 		 582 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  36.8 
 
 		 582 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  36.69 
 
 		 610 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0402  ABC transporter related  37.16 
 
 		 645 aa  354  2.9999999999999997e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.176731  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  37.08 
 
 		 588 aa  353  4e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.42 
 
 		 597 aa  351  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  35.03 
 
 		 572 aa  350  4e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  34.65 
 
 		 607 aa  350  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  33.04 
 
 		 587 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  35.36 
 
 		 572 aa  347  5e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  34.42 
 
 		 578 aa  345  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  34.42 
 
 		 578 aa  345  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  35.79 
 
 		 760 aa  343  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  33.91 
 
 		 594 aa  343  4e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  36.12 
 
 		 784 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  32.09 
 
 		 597 aa  342  8e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  33.16 
 
 		 580 aa  343  8e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  36.33 
 
 		 764 aa  342  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  33.79 
 
 		 579 aa  342  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  31.8 
 
 		 597 aa  342  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.28 
 
 		 614 aa  341  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  31.81 
 
 		 617 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  37.46 
 
 		 582 aa  340  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  36.96 
 
 		 566 aa  340  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  34.06 
 
 		 576 aa  340  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.59 
 
 		 572 aa  340  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  36.16 
 
 		 608 aa  340  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  35.57 
 
 		 782 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  34.22 
 
 		 636 aa  338  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  36.07 
 
 		 726 aa  337  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  35.75 
 
 		 588 aa  337  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  32.66 
 
 		 622 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.78 
 
 		 598 aa  337  3.9999999999999995e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  36.23 
 
 		 641 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  37.18 
 
 		 609 aa  337  5e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.01 
 
 		 578 aa  336  5.999999999999999e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  35.05 
 
 		 640 aa  336  5.999999999999999e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  35.53 
 
 		 565 aa  336  5.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  32.71 
 
 		 597 aa  336  5.999999999999999e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  34.67 
 
 		 556 aa  336  7e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  32.17 
 
 		 582 aa  335  9e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  32.76 
 
 		 594 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  37.16 
 
 		 567 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  37.23 
 
 		 567 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  33.84 
 
 		 586 aa  334  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  35.71 
 
 		 773 aa  335  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  35.52 
 
 		 784 aa  334  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>