76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5304 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  100 
 
 		 148 aa  292  9e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  44 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  44.59 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  44.59 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  44.59 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  44.59 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  42.31 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  41.1 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  41.18 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  42.86 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  41.33 
 
 		 123 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  38.46 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  41.89 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  41.89 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  41.33 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  40.26 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  38.16 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  41.89 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  34.57 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  37.66 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  43.33 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  35.8 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  37.84 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  37.84 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  40 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  39.19 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  37.84 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  43.24 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  39.19 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  37.84 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  36.99 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  36.49 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  31.65 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  36.25 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  34.21 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  34.62 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  35.53 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  36.49 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  32.1 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  32.1 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  32.1 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  32.1 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  32.1 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  32.1 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  32.1 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  32.1 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  32.1 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  34.67 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  28.75 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  33.77 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  36.49 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  31.58 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  32.91 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  35.59 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  32 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  32.94 
 
 		 215 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  32.94 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  32.94 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  32.94 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3458  GrxB family glutaredoxin  28.83 
 
 		 231 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142149  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  32.5 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  28 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  32.94 
 
 		 215 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  36.67 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  34.38 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  31.33 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  37.04 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  30.86 
 
 		 249 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  33.33 
 
 		 78 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  31.67 
 
 		 384 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  33.82 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  28.57 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>