More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2308 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 395 aa  799    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  55.13 
 
 		 496 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  54.76 
 
 		 500 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  55.01 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  54.69 
 
 		 492 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  39.14 
 
 		 382 aa  286  5.999999999999999e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 382 aa  272  9e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  38.66 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  36 
 
 		 390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  37.02 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  34.64 
 
 		 385 aa  225  8e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  36.53 
 
 		 386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  38.28 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 		 385 aa  206  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 385 aa  202  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  34.63 
 
 		 378 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 385 aa  192  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 376 aa  190  4e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 		 413 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2494  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.207468  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 412 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  38.38 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0945  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.98 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  31.61 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.2 
 
 		 417 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2478  sarcosine oxidase, beta subunit  29.46 
 
 		 416 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4032  sarcosine oxidase, beta subunit  29.46 
 
 		 416 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4031  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.9 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0301  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.51 
 
 		 417 aa  153  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  31.7 
 
 		 446 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3736  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.9 
 
 		 417 aa  153  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.42969  normal  0.377029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0591  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.31 
 
 		 417 aa  152  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3991  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.73 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2760  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.76 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.51 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3856  sarcosine oxidase subunit beta  30.73 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.014492  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4131  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.27 
 
 		 416 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3661  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.17 
 
 		 417 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616865  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71470  sarcosine oxidase beta subunit  28.07 
 
 		 416 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0229  sarcosine oxidase, beta subunit  26.94 
 
 		 417 aa  149  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6204  sarcosine oxidase subunit beta  28.07 
 
 		 416 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194283  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0992  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.72 
 
 		 417 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8584  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.61 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738598  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 		 444 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 		 444 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0869  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2487  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.46 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0998  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.53 
 
 		 416 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3358  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.17 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 		 444 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  31.51 
 
 		 442 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.49 
 
 		 414 aa  146  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 442 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 442 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  31.51 
 
 		 442 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  31.51 
 
 		 442 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 442 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  31.51 
 
 		 442 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5207  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  26.9 
 
 		 416 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0460  sarcosine oxidase, beta subunit  26.9 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 799 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 816 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.06 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2117  sarcosine oxidase subunit beta  26.03 
 
 		 417 aa  144  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.08 
 
 		 415 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  28.08 
 
 		 415 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 		 444 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4713  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  26.9 
 
 		 416 aa  143  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4884  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.98 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0323  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.25 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.968117  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0345  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.25 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  30.3 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0346  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.25 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 816 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 455 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 806 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2752  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.45 
 
 		 417 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 444 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3704  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.79 
 
 		 406 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  26.68 
 
 		 406 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 815 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5048  sarcosine oxidase, beta subunit family  26.7 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.275422  normal  0.249273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>