249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1388 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1388  Methyltransferase type 11  100 
 
 
194 aa  390  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  49.73 
 
 
198 aa  185  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2196  Methyltransferase type 12  48.13 
 
 
192 aa  183  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114606  decreased coverage  0.00107741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  34.51 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  32.81 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  31.58 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  30.77 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 
211 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2535  methyltransferase type 12  35.86 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  0.207866 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 
218 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.97 
 
 
244 aa  61.6  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  25.88 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  28.57 
 
 
222 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  40.19 
 
 
286 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  34.58 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3873  Methyltransferase type 12  28.32 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4401  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 
236 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  35.79 
 
 
252 aa  55.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  30.15 
 
 
200 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
201 aa  55.1  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  32.9 
 
 
241 aa  55.1  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
252 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  32.61 
 
 
199 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  30 
 
 
225 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
200 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.94 
 
 
236 aa  54.7  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  32.79 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 
208 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 
222 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  31.69 
 
 
575 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  32.74 
 
 
244 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  32 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
268 aa  52  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  28.05 
 
 
215 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  32.61 
 
 
200 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  30.33 
 
 
272 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4186  hypothetical protein  51.11 
 
 
57 aa  51.2  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  34.27 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
270 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  29.38 
 
 
261 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  29.23 
 
 
222 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  38.54 
 
 
200 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0212  hypothetical protein  29.57 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 
214 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2026  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  27.66 
 
 
274 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  38.32 
 
 
284 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  33.66 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  30.66 
 
 
218 aa  49.3  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.97 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 
246 aa  49.3  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 
254 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  25.38 
 
 
200 aa  49.3  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
225 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.63 
 
 
200 aa  48.9  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2180  putative methyltransferase  33.57 
 
 
239 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  27.54 
 
 
541 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  29.91 
 
 
217 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  32.74 
 
 
196 aa  48.5  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0141  methyltransferase type 11  27.83 
 
 
233 aa  48.5  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  31 
 
 
218 aa  48.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  27.97 
 
 
227 aa  48.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  28.26 
 
 
541 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  25.58 
 
 
196 aa  48.1  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 
259 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  31.96 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 
269 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  32.71 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  24.51 
 
 
249 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0230  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 
344 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.183914 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  38.95 
 
 
257 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0496  hypothetical protein  32.77 
 
 
229 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.340166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  28.35 
 
 
429 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.73 
 
 
277 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3273  Methyltransferase type 12  29 
 
 
210 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  25.93 
 
 
190 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  24.83 
 
 
210 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  30.38 
 
 
244 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  27.54 
 
 
541 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
232 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  29.79 
 
 
202 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  33.57 
 
 
323 aa  45.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
262 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 
220 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  30.84 
 
 
275 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 
246 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
242 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  29.17 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.19 
 
 
234 aa  45.8  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  28.16 
 
 
209 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  26.62 
 
 
234 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 
365 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1170  methyltransferase type 11  31.91 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0322636  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
237 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  33.67 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>