More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1063 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  100 
 
 		 194 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3618  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  52.17 
 
 		 211 aa  195  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4267  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  51.63 
 
 		 210 aa  192  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  51.61 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3776  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  51.09 
 
 		 211 aa  191  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  50.55 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0315  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.54 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  47.87 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  48.9 
 
 		 188 aa  185  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  49.46 
 
 		 210 aa  184  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  49.46 
 
 		 210 aa  184  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  49.46 
 
 		 210 aa  184  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  49.46 
 
 		 210 aa  184  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  51.65 
 
 		 206 aa  184  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  48.35 
 
 		 200 aa  184  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  49.46 
 
 		 210 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  50 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0666  ADP-ribose diphosphatase  50 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  50 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3329  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746955 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3467  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0321029  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  51.89 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  44.97 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  44.97 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  50.28 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.54 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  49.17 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0769  ADP-ribose diphosphatase  46.35 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  46.7 
 
 		 202 aa  177  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  44.97 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  49.17 
 
 		 208 aa  176  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  45.86 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  44.97 
 
 		 200 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1377  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 		 196 aa  173  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  48.9 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  48.9 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  49.45 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0027  NUDIX hydrolase  48.09 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0324  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  51.63 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000684842  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2674  ADP-ribose pyrophosphatase  47.34 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  48.9 
 
 		 205 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0283  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50 
 
 		 210 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0574  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50 
 
 		 210 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0655  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50 
 
 		 210 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  47.25 
 
 		 205 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  48.35 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  44.51 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  48.07 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00870  hypothetical protein  46.15 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  47.51 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  52.49 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  52.49 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4180  ADP-ribose pyrophosphatase  48.59 
 
 		 214 aa  164  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2556  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  45.74 
 
 		 209 aa  164  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0370  ADP-ribose pyrophosphatase  41.76 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1477  hypothetical protein  45.9 
 
 		 200 aa  155  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1525  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  50.94 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.411844  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0804  NUDIX hydrolase  49.72 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2146  tellurite resistance protein  42.7 
 
 		 361 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0820  NUDIX hydrolase  42.7 
 
 		 361 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0818  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 362 aa  147  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0580  ADP-ribose diphosphatase  40.22 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 		 204 aa  137  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1358  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  41.62 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  39.89 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3722  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  40 
 
 		 214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2315  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 378 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1992  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.11 
 
 		 375 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3860  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 		 368 aa  108  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2637  NUDIX hydrolase  38.42 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4209  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 212 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146155  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  31.89 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1775  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.36 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  33.7 
 
 		 194 aa  99  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 		 202 aa  96.3  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 195 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 		 198 aa  94.7  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  32.02 
 
 		 198 aa  94.4  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  31.32 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  31.32 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  31.32 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  31.32 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  37.5 
 
 		 192 aa  87.8  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  33.15 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  27.62 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  33.73 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>