62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0586 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  496  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  42.41 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  37.11 
 
 		 222 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  36.9 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  36.02 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  37.36 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  31.85 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  34.68 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  32.73 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  35.62 
 
 		 200 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  31.66 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  32.58 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  32.79 
 
 		 344 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  32.98 
 
 		 251 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  32 
 
 		 404 aa  98.6  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  38.31 
 
 		 181 aa  98.2  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  31.22 
 
 		 382 aa  96.3  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  33.96 
 
 		 179 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  29.71 
 
 		 382 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  29.06 
 
 		 342 aa  95.5  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 194 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  39.62 
 
 		 174 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  39.62 
 
 		 174 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  33.15 
 
 		 195 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  35.15 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  30.72 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  34.18 
 
 		 180 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  31.82 
 
 		 344 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 346 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  30.05 
 
 		 348 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  28.8 
 
 		 360 aa  89.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 187 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 174 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  30.37 
 
 		 355 aa  89  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  30.61 
 
 		 180 aa  88.2  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 180 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  30.85 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0157  hypothetical protein  33.16 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000097536  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  34.55 
 
 		 171 aa  81.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  31.54 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  34.91 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  32.45 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  32.03 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  32.03 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  31.36 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  32.67 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.22 
 
 		 425 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  30.84 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  30.84 
 
 		 304 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  30.84 
 
 		 304 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  32.37 
 
 		 773 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  27.84 
 
 		 678 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2542  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.31 
 
 		 294 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  54.29 
 
 		 429 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  30.3 
 
 		 1113 aa  42.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  44.74 
 
 		 220 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  28.71 
 
 		 291 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  29.29 
 
 		 327 aa  42  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  31.52 
 
 		 201 aa  42  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>