More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1100 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
302 aa  590  1e-168  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  64.98 
 
 
294 aa  322  4e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  61.74 
 
 
302 aa  300  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  57.28 
 
 
310 aa  285  5e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0296  2-dehydropantoate 2-reductase  57 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.961677  normal  0.11487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  36.77 
 
 
301 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  36.57 
 
 
300 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  36.57 
 
 
299 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  33.21 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  37.34 
 
 
299 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  38.69 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  36.84 
 
 
309 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  37.83 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  39.47 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  35.92 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  35.22 
 
 
295 aa  132  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  37.5 
 
 
319 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  35.08 
 
 
298 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  36.77 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  39.32 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  37 
 
 
325 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  37.46 
 
 
310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  38.76 
 
 
307 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
314 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  34.78 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  34.78 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  32.99 
 
 
307 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  39.86 
 
 
296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  38.03 
 
 
316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  38.03 
 
 
316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  36.18 
 
 
317 aa  116  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  35.6 
 
 
316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  34.87 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  32.24 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  34.15 
 
 
306 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 
303 aa  112  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  34.01 
 
 
307 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  33.67 
 
 
312 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  33.88 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 
278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  33.88 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  37.09 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  29 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  39.62 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  37.54 
 
 
313 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  36.94 
 
 
316 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 
303 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  37.46 
 
 
318 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
303 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  37.46 
 
 
318 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  37.46 
 
 
318 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  37.46 
 
 
318 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  32.57 
 
 
303 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  27.87 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  27.96 
 
 
307 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  32.34 
 
 
307 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2147  2-dehydropantoate 2-reductase  35.27 
 
 
303 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  37.66 
 
 
310 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  36.07 
 
 
341 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  39.1 
 
 
314 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  35.29 
 
 
332 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  39.1 
 
 
314 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  32.24 
 
 
303 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  32.24 
 
 
303 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  32.24 
 
 
303 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  32.24 
 
 
303 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  36.62 
 
 
316 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  37.05 
 
 
316 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 
316 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2874  2-dehydropantoate 2-reductase  34.67 
 
 
336 aa  105  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  35.05 
 
 
312 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3080  2-dehydropantoate 2-reductase  31.37 
 
 
306 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.850912  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  34 
 
 
303 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  30.99 
 
 
312 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  36.98 
 
 
314 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  35.69 
 
 
335 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  29.34 
 
 
320 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  37.46 
 
 
310 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  33.81 
 
 
306 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  33.88 
 
 
315 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  31.1 
 
 
303 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  34.51 
 
 
312 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  36.81 
 
 
318 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  35.13 
 
 
323 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 
296 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  32.39 
 
 
343 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
311 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 
311 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  34.21 
 
 
315 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  27.39 
 
 
305 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  37.12 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  28.34 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  32.24 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  29.24 
 
 
309 aa  97.4  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>