164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0910 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0910  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
418 aa  805    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3958  major facilitator superfamily MFS_1  50.22 
 
 
451 aa  423  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1768  major facilitator superfamily MFS_1  51.5 
 
 
432 aa  409  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0114747 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0223  major facilitator superfamily MFS_1  52.04 
 
 
413 aa  404  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.339791  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2072  major facilitator superfamily MFS_1  48.37 
 
 
384 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1619  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 
430 aa  144  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00015243  normal  0.333311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  27.32 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.01 
 
 
395 aa  94.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.26 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  21.97 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  25.51 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.07 
 
 
409 aa  67  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 
430 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  24.54 
 
 
399 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  23.83 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  26.47 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  24.08 
 
 
410 aa  60.5  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 
429 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  21.91 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  27.32 
 
 
429 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  25.49 
 
 
406 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 
397 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.34 
 
 
516 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 
397 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.34 
 
 
514 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 
400 aa  54.3  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 
391 aa  53.9  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  24.47 
 
 
407 aa  53.5  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  26.22 
 
 
411 aa  53.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  26.92 
 
 
402 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  23.5 
 
 
487 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  23.53 
 
 
440 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  23.89 
 
 
400 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  26.88 
 
 
411 aa  51.2  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  22.9 
 
 
406 aa  51.2  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25.2 
 
 
394 aa  51.2  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  24.37 
 
 
429 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  26.34 
 
 
409 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  22.63 
 
 
409 aa  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  31.34 
 
 
398 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  29.71 
 
 
432 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
406 aa  50.1  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  29.71 
 
 
432 aa  49.7  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  29.71 
 
 
432 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 
415 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  29.71 
 
 
432 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  24.73 
 
 
421 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  29.61 
 
 
464 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  29.61 
 
 
464 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  29.71 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2141  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 
462 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.154122 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  22.54 
 
 
400 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.06 
 
 
505 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  24.51 
 
 
403 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.76 
 
 
520 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  29.31 
 
 
403 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 
408 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 
403 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 
403 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1801  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.97 
 
 
504 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0797811  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 
646 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 
646 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  29.45 
 
 
462 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 
411 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  22.22 
 
 
400 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.26 
 
 
483 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  29.05 
 
 
464 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  31.29 
 
 
387 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.82 
 
 
646 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  24.54 
 
 
407 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  24.69 
 
 
475 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
489 aa  47  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 
427 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
414 aa  46.6  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.92 
 
 
476 aa  46.6  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  27.01 
 
 
454 aa  46.6  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  27.01 
 
 
454 aa  46.6  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  27.01 
 
 
454 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 
454 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  20.05 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0271  major facilitator transporter  28.67 
 
 
469 aa  46.2  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.00524997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  27.93 
 
 
462 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  22.66 
 
 
411 aa  46.2  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  27.93 
 
 
454 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  27.01 
 
 
454 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  27.01 
 
 
454 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  27.01 
 
 
454 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 
410 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  27.01 
 
 
454 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  27.01 
 
 
454 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  27.01 
 
 
454 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  27.97 
 
 
434 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  27.01 
 
 
454 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>