91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1979 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1979  Tubulin  100 
 
 		 625 aa  1264    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0773401 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1379  hypothetical protein  65.76 
 
 		 604 aa  813    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2277  hypothetical protein  68.74 
 
 		 653 aa  833    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0611  ATPase-like protein  68.91 
 
 		 618 aa  864    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1658  hypothetical protein  69.35 
 
 		 604 aa  848    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  43.77 
 
 		 783 aa  511  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  42.43 
 
 		 605 aa  497  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2787  hypothetical protein  32.27 
 
 		 624 aa  256  7e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2256  hypothetical protein  25.91 
 
 		 651 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  22.42 
 
 		 496 aa  65.5  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3912  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  24.43 
 
 		 579 aa  58.5  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  27.86 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  30.46 
 
 		 540 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1440  hypothetical protein  23.5 
 
 		 539 aa  57  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  21.59 
 
 		 557 aa  57  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  22.53 
 
 		 508 aa  57  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  20.21 
 
 		 550 aa  55.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  29.81 
 
 		 679 aa  55.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  28.57 
 
 		 427 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  28.3 
 
 		 591 aa  54.7  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3713  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  24.11 
 
 		 580 aa  54.3  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  36.99 
 
 		 599 aa  53.9  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  23.98 
 
 		 530 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1512  AAA ATPase  22.61 
 
 		 595 aa  53.5  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000264338  normal  0.723812 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  23.77 
 
 		 530 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  31.25 
 
 		 591 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  37.66 
 
 		 569 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  29.27 
 
 		 360 aa  53.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4680  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  24.78 
 
 		 529 aa  53.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218814  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1736  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.21 
 
 		 629 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  26.67 
 
 		 595 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  26.29 
 
 		 544 aa  52.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  22.16 
 
 		 605 aa  51.6  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  32.18 
 
 		 526 aa  51.6  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1140  protein of unknown function DUF87  31.82 
 
 		 554 aa  51.2  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  31.43 
 
 		 587 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  24.59 
 
 		 594 aa  50.4  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  32.04 
 
 		 623 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  28.38 
 
 		 546 aa  50.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  26.9 
 
 		 709 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  27.88 
 
 		 709 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  29 
 
 		 537 aa  49.3  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1273  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  21.41 
 
 		 520 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1336  hypothetical protein  24.32 
 
 		 509 aa  49.7  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  23.48 
 
 		 530 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  32.26 
 
 		 600 aa  48.9  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  33.71 
 
 		 575 aa  48.9  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  22.79 
 
 		 693 aa  48.5  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  29.37 
 
 		 532 aa  48.9  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  29.57 
 
 		 570 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1702  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  24.11 
 
 		 502 aa  48.5  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  24.79 
 
 		 579 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1551  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25 
 
 		 490 aa  47.8  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  26.9 
 
 		 607 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  27.27 
 
 		 714 aa  47.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  29.46 
 
 		 574 aa  47.4  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  29.57 
 
 		 567 aa  47  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  25.23 
 
 		 608 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  26.09 
 
 		 540 aa  46.6  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  25.23 
 
 		 608 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1897  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  23.65 
 
 		 503 aa  47  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0908491  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2082  AAA ATPase  26.05 
 
 		 600 aa  47  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.901274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  21.3 
 
 		 513 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  32.11 
 
 		 530 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2221  hypothetical protein  23.89 
 
 		 497 aa  46.2  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  29.36 
 
 		 593 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2387  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  22.71 
 
 		 520 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2074  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  26.83 
 
 		 526 aa  45.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504817  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0444  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  24.32 
 
 		 524 aa  45.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0693836  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  20.39 
 
 		 564 aa  45.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  24.83 
 
 		 557 aa  45.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0795  ATPase-like protein  31.53 
 
 		 396 aa  44.7  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.412059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2056  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.5 
 
 		 552 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2217  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.08 
 
 		 560 aa  44.7  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3644  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  23.98 
 
 		 523 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.852861  normal  0.874146 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  28.57 
 
 		 559 aa  44.7  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1374  protein of unknown function DUF87  22.97 
 
 		 538 aa  44.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  21.95 
 
 		 546 aa  44.3  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2189  hypothetical protein  23.17 
 
 		 535 aa  44.3  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0102  HerA-ATP synthase, barrel domain protein  27.63 
 
 		 609 aa  44.7  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  27.07 
 
 		 570 aa  44.3  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1882  protein of unknown function DUF87  25.64 
 
 		 581 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000610913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  24.27 
 
 		 612 aa  44.3  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  25.86 
 
 		 583 aa  43.9  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  26.92 
 
 		 579 aa  43.9  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  25.49 
 
 		 500 aa  43.9  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1479  hypothetical protein  34.62 
 
 		 580 aa  43.9  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0102316  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  22.73 
 
 		 670 aa  43.5  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  21.82 
 
 		 659 aa  43.9  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  35.71 
 
 		 495 aa  43.9  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2768  hypothetical protein  26.55 
 
 		 508 aa  43.9  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.410021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>