More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0508 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 
903 aa  1797    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  33.89 
 
 
890 aa  498  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  34.71 
 
 
866 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  36.96 
 
 
865 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  35.49 
 
 
870 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  32.67 
 
 
868 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  32.67 
 
 
868 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 
874 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  31.85 
 
 
868 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  33.15 
 
 
871 aa  456  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  32.11 
 
 
868 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  32.37 
 
 
868 aa  452  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  32.52 
 
 
869 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  32.12 
 
 
869 aa  452  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  32.59 
 
 
868 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.37 
 
 
887 aa  445  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  31.86 
 
 
868 aa  444  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  36.01 
 
 
873 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  33.18 
 
 
837 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.34 
 
 
887 aa  385  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  35.87 
 
 
907 aa  385  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  36.76 
 
 
867 aa  359  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  32.87 
 
 
906 aa  347  7e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  34.84 
 
 
826 aa  340  9e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.94 
 
 
891 aa  323  7e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  32.97 
 
 
886 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.76 
 
 
821 aa  300  9e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  40.64 
 
 
891 aa  283  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  32.47 
 
 
971 aa  275  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.71 
 
 
889 aa  271  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  37.75 
 
 
868 aa  254  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  43.73 
 
 
842 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  45.95 
 
 
780 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  25.37 
 
 
868 aa  237  8e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  44.77 
 
 
788 aa  236  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  46.28 
 
 
785 aa  234  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.46 
 
 
902 aa  232  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  47.08 
 
 
760 aa  231  3e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  45.45 
 
 
840 aa  231  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  28.26 
 
 
885 aa  230  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  43.96 
 
 
799 aa  230  9e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  39.09 
 
 
869 aa  228  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  44.81 
 
 
785 aa  227  6e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  39.2 
 
 
852 aa  227  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.64 
 
 
811 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  39.95 
 
 
892 aa  226  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  28.28 
 
 
885 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  39.38 
 
 
825 aa  214  3.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  44.94 
 
 
835 aa  213  9e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  40.57 
 
 
769 aa  213  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  38.54 
 
 
758 aa  211  5e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  37.9 
 
 
758 aa  209  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  39.17 
 
 
758 aa  208  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.1 
 
 
950 aa  207  9e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.59 
 
 
810 aa  205  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  37.15 
 
 
781 aa  204  5e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  36.94 
 
 
757 aa  204  7e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  40.18 
 
 
359 aa  204  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  29.02 
 
 
788 aa  203  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  41.56 
 
 
366 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  36.25 
 
 
758 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  36.25 
 
 
758 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.91 
 
 
302 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  36.16 
 
 
758 aa  197  6e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  38.01 
 
 
824 aa  196  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  37.42 
 
 
382 aa  194  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  35.76 
 
 
754 aa  194  5e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  39.22 
 
 
815 aa  193  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  39.09 
 
 
364 aa  190  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  39.38 
 
 
760 aa  189  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  38.46 
 
 
782 aa  189  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  36.45 
 
 
762 aa  187  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  35.19 
 
 
764 aa  187  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  40.54 
 
 
810 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  35.43 
 
 
758 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  36.48 
 
 
762 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  35.81 
 
 
761 aa  185  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  37.76 
 
 
799 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  37.76 
 
 
799 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  37.76 
 
 
799 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  37.76 
 
 
799 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  37.76 
 
 
799 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  37.76 
 
 
799 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  37.76 
 
 
812 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.94 
 
 
975 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  37.16 
 
 
800 aa  184  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  37.16 
 
 
800 aa  184  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  37.16 
 
 
800 aa  184  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  35.86 
 
 
779 aa  184  8.000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  36.56 
 
 
799 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  37.46 
 
 
799 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  37.46 
 
 
799 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  37.16 
 
 
799 aa  183  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2757  phosphoenolpyruvate synthase  37.85 
 
 
825 aa  183  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  35.95 
 
 
801 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  35.95 
 
 
800 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  36.67 
 
 
801 aa  182  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  36.56 
 
 
800 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  33.8 
 
 
804 aa  180  9e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  36.56 
 
 
801 aa  180  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>