More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0397 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0333  putative ATPase RIL  76.23 
 
 		 610 aa  969    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0939  putative ATPase RIL  58.07 
 
 		 589 aa  692    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3503  ABC transporter related protein  80.33 
 
 		 604 aa  1011    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1568  putative ATPase RIL  56.26 
 
 		 589 aa  683    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1549  ABC transporter related protein  78.84 
 
 		 604 aa  998    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.547785  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0397  putative ATPase RIL  100 
 
 		 606 aa  1238    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3509  putative ATPase RIL  58.17 
 
 		 588 aa  688    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358923 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1854  putative ATPase RIL  59.77 
 
 		 589 aa  707    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.285578  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0309  putative ATPase RIL  78.2 
 
 		 609 aa  986    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0007  putative ATPase RIL  57 
 
 		 584 aa  660    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1332  putative ATPase RIL  56.76 
 
 		 590 aa  684    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.178522  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0542  putative ATPase RIL  52.25 
 
 		 600 aa  630  1e-179  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0356445  normal  0.109277 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0435  putative ATPase RIL  53.76 
 
 		 588 aa  627  1e-178  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.985617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0528  putative ATPase RIL  50 
 
 		 590 aa  592  1e-168  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1380  putative ATPase RIL  50 
 
 		 590 aa  591  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0776599  normal  0.169573 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0399  ABC transporter related protein  48.42 
 
 		 586 aa  590  1e-167  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1256  putative ATPase RIL  49.92 
 
 		 590 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.811712  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1369  putative ATPase RIL  49.17 
 
 		 590 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0651  putative ATPase RIL  47.67 
 
 		 592 aa  568  1e-161  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0212  putative ATPase RIL  47.02 
 
 		 601 aa  554  1e-156  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0295  putative ATPase RIL  43.89 
 
 		 595 aa  543  1e-153  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00910203 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1264  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 600 aa  525  1e-148  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27256  predicted protein  44.48 
 
 		 611 aa  523  1e-147  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0894318 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29654  predicted protein  44.48 
 
 		 611 aa  523  1e-147  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190452  normal  0.17762 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1496  putative ATPase RIL  44.54 
 
 		 590 aa  519  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1558  putative ATPase RIL  44.21 
 
 		 590 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000149119 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07330  hypothetical protein  43.47 
 
 		 603 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0738  putative ATPase RIL  45.9 
 
 		 604 aa  515  1.0000000000000001e-145  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0393541 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1686  putative ATPase RIL  44.79 
 
 		 589 aa  511  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000842642 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0625  putative ATPase RIL  43.54 
 
 		 590 aa  505  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000179458  hitchhiker  0.000000208503 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_1048  phosphatase  42.11 
 
 		 623 aa  504  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495002  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2258  putative ATPase RIL  41.56 
 
 		 600 aa  495  1e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.306983 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01256  RNase L inhibitor of the ABC superfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10310)  42.94 
 
 		 564 aa  408  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.192444 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  27.64 
 
 		 607 aa  120  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.57 
 
 		 560 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  24.04 
 
 		 634 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4945  ABC transporter related  26.51 
 
 		 561 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.01 
 
 		 556 aa  118  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  27.03 
 
 		 653 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  24.42 
 
 		 624 aa  117  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  28.11 
 
 		 547 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.57 
 
 		 553 aa  117  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  28.54 
 
 		 555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.67 
 
 		 561 aa  115  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.06 
 
 		 554 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  26.94 
 
 		 632 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.32 
 
 		 559 aa  114  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1761  ABC transporter related  25.25 
 
 		 647 aa  114  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  24.88 
 
 		 636 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.97 
 
 		 557 aa  113  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  27.36 
 
 		 634 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.97 
 
 		 557 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  26.29 
 
 		 568 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  22.99 
 
 		 620 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  24.68 
 
 		 656 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.65 
 
 		 555 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  25.95 
 
 		 659 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.93 
 
 		 556 aa  111  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.1 
 
 		 560 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0416  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.84 
 
 		 553 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.65 
 
 		 705 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2713  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.45 
 
 		 555 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  25.2 
 
 		 543 aa  110  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  25.78 
 
 		 575 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  27.19 
 
 		 564 aa  110  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  26.79 
 
 		 540 aa  110  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  24.16 
 
 		 636 aa  110  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  26.81 
 
 		 518 aa  109  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.16 
 
 		 559 aa  109  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.84 
 
 		 555 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.84 
 
 		 555 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.84 
 
 		 555 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.16 
 
 		 559 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.84 
 
 		 555 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0489  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.65 
 
 		 555 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890406 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2881  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.65 
 
 		 555 aa  109  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.41932  normal  0.0832413 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  26.72 
 
 		 527 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.45 
 
 		 555 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.84 
 
 		 555 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  23.36 
 
 		 643 aa  109  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.65 
 
 		 555 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.84 
 
 		 555 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.84 
 
 		 555 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4130  ABC transporter related  26.25 
 
 		 533 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3604  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.43 
 
 		 555 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0421  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.43 
 
 		 555 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0447  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.43 
 
 		 570 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46914  normal  0.303037 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  25.48 
 
 		 630 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.55 
 
 		 560 aa  107  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  25.94 
 
 		 530 aa  107  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  25.14 
 
 		 631 aa  107  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3514  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.65 
 
 		 554 aa  106  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491494  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.75 
 
 		 670 aa  107  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  23.68 
 
 		 630 aa  106  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3988  ABC transporter, ATPase subunit  26.45 
 
 		 533 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4100  ABC transporter-related protein  26.45 
 
 		 533 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.39 
 
 		 553 aa  105  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0644  peptidase T (tripeptide aminopeptidase; aminotripeptidase; tripeptidase)  23.87 
 
 		 643 aa  105  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.85 
 
 		 555 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  23.58 
 
 		 653 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>