More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1421 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 113 aa  228  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  56.98 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  49.41 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0476  transcriptional regulator, ArsR family  47.31 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  52.56 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  52.56 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  47.13 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2641  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.257894  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  48.05 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  37.21 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  43.75 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  44.93 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  36.59 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 324 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  38.04 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  37.65 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  38.04 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  37.08 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  37.36 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  41.11 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  36.05 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  34.09 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  36.47 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1723  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  34.09 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  30 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1557  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0128912  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 		 342 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  45.21 
 
 		 349 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3740  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>