More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0811 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0811  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
558 aa  1003    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.65371  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1279  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  42.78 
 
 
565 aa  239  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1023  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  49 
 
 
555 aa  219  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.057602  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0999  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  40.31 
 
 
574 aa  210  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2661  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.92 
 
 
556 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01540  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  41.65 
 
 
587 aa  179  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1581  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.82 
 
 
563 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1038  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.16 
 
 
544 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0466413 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0918  NADH dehydrogenase (quinone)  29.82 
 
 
559 aa  134  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  27.69 
 
 
500 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  33.2 
 
 
674 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  28.1 
 
 
748 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  33.22 
 
 
674 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  34.9 
 
 
1264 aa  107  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  32.65 
 
 
637 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  25.68 
 
 
688 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  31.96 
 
 
669 aa  100  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  31.36 
 
 
1253 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  28.97 
 
 
1265 aa  98.6  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  30.28 
 
 
499 aa  97.8  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  33.59 
 
 
669 aa  97.8  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0336  NADH dehydrogenase (quinone)  30.95 
 
 
665 aa  98.2  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  32.65 
 
 
687 aa  97.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  33.06 
 
 
683 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  31.78 
 
 
674 aa  96.3  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  33.45 
 
 
669 aa  96.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  34.03 
 
 
748 aa  95.9  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  26.09 
 
 
662 aa  95.9  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  31.38 
 
 
672 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  31.38 
 
 
672 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  31.38 
 
 
672 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  31.38 
 
 
672 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  31.38 
 
 
672 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1307  NADH dehydrogenase (quinone)  26.33 
 
 
633 aa  95.5  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0812  NADH dehydrogenase (quinone)  34.32 
 
 
503 aa  95.1  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.114491  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  30.96 
 
 
672 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  35.11 
 
 
669 aa  94.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  31.71 
 
 
674 aa  94  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  28.87 
 
 
1265 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  29.13 
 
 
525 aa  93.2  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01550  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  35.96 
 
 
505 aa  91.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  27.6 
 
 
673 aa  91.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  35.76 
 
 
666 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  36.18 
 
 
671 aa  91.7  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  33 
 
 
672 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  31.73 
 
 
649 aa  91.3  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  35.42 
 
 
666 aa  90.9  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01560  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  37.04 
 
 
493 aa  90.1  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.91 
 
 
523 aa  90.1  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000590255  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3667  NADH dehydrogenase (quinone)  31.59 
 
 
496 aa  89.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  27.65 
 
 
655 aa  89.7  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  34.24 
 
 
672 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  27.63 
 
 
655 aa  89.7  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  31.17 
 
 
671 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1000  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.89 
 
 
507 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.827251 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0210  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.96 
 
 
525 aa  89  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.924509  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  28.42 
 
 
531 aa  89.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  34.26 
 
 
585 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  32.82 
 
 
646 aa  89  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3285  NADH dehydrogenase (quinone)  30.84 
 
 
496 aa  88.6  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0676667  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  36.11 
 
 
665 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  35.29 
 
 
554 aa  88.2  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.31 
 
 
545 aa  88.6  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0669  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.02 
 
 
538 aa  88.6  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  27.35 
 
 
499 aa  88.2  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0496  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.65 
 
 
565 aa  88.2  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0184  NADH dehydrogenase (quinone)  29.08 
 
 
487 aa  88.2  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1398  NADH dehydrogenase (quinone)  31.96 
 
 
498 aa  87.4  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1673  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.82 
 
 
604 aa  87.4  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2985  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.78 
 
 
674 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0690807  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  36 
 
 
668 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  30.35 
 
 
643 aa  86.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5103  NADH dehydrogenase (quinone)  32.96 
 
 
584 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  29.13 
 
 
667 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  27.36 
 
 
498 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  28.74 
 
 
486 aa  85.9  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.48 
 
 
500 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13350  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  29.07 
 
 
939 aa  85.1  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0751  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.33 
 
 
542 aa  85.1  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5153  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.63 
 
 
548 aa  85.1  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.939463  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3954  NADH dehydrogenase (quinone)  30.46 
 
 
497 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  24.88 
 
 
480 aa  84.7  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.62 
 
 
538 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.67 
 
 
538 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0845  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.87 
 
 
698 aa  84  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  24.69 
 
 
480 aa  84  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1617  hydrogenase 4 subunit B  34.14 
 
 
668 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1532  hydrogenase 4 subunit B  34.14 
 
 
668 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  26.15 
 
 
672 aa  84  0.000000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2158  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.27 
 
 
589 aa  83.6  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.812368  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4892  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.78 
 
 
552 aa  83.6  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10084  oxidoreductase  34.57 
 
 
640 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  normal  0.170471 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2966  NADH dehydrogenase (quinone)  29.45 
 
 
501 aa  83.2  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.278298 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1634  NADH dehydrogenase (quinone)  32.03 
 
 
490 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181583  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2437  NADH dehydrogenase (quinone)  29.23 
 
 
530 aa  83.2  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.366515 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.36 
 
 
661 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  27.02 
 
 
662 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0790  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.09 
 
 
500 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12060  NADH dehydrogenase I subunit L  28.1 
 
 
506 aa  82  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000252399  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3956  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.61 
 
 
566 aa  82  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>