278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5088 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5088  demethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 236 aa  466  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3295  demethylmenaquinone methyltransferase  55.17 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  31.44 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.51 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.77 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  30.73 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  28.95 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  30.81 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1080  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.76 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.59 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  30.07 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  29.27 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  35.21 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.07 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.35 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.69 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.32 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.43 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.57 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  30.11 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4017  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.35 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.59 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4782  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.14 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  26.87 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3066  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.49 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.65 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  30.49 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  26.32 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1257  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.32 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  28.95 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.65 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.06 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.11 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.14 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5773  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.61 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.73 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.88 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3023  hypothetical protein  31.85 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  27.06 
 
 		 438 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.59 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.19 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  31.1 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39280  predicted protein  33.33 
 
 		 140 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.632179 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  32.59 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0566  demethylmenaquinone methyltransferase  26.64 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  27.68 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2046  hypothetical protein  26.35 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63945  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.09 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.61 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.07 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3520  hypothetical protein  30.72 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.57 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4783  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.77 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.57 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3497  hypothetical protein  31.78 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00582186 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.67 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.09 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.85 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  32.71 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  24.21 
 
 		 429 aa  59.3  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  27.85 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  29.8 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  30.19 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9410  demethylmenaquinone methyltransferase  30.97 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.87 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1073  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.68 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.235046  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.23 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3327  ribonuclease activity regulator protein RraA  25.47 
 
 		 159 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  31.3 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  24.64 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  28.86 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.71 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.71 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3608  hypothetical protein  27.66 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  27.89 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3012  ribonuclease activity regulator protein RraA  26 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000537886  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.95 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5396  Dimethylmenaquinone methyltransferase  27.36 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.666245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1909  ribonuclease activity regulator protein RraA  24.69 
 
 		 159 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  25.12 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3787  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.33 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.924473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  28.05 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3109  ribonuclease activity regulator protein RraA  25.47 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0610  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.93 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.398113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.35 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  27.72 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0894  putative transferase  26.79 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3341  ribonuclease activity regulator protein RraA  25.47 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2458  DlpA domain-containing protein  26.79 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.06 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2594  demethylmenaquinone methyltransferase  26.79 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.06 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  25.9 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3047  ribonuclease activity regulator protein RraA  24.84 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3341  ribonuclease activity regulator protein RraA  32.17 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.41 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  30 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>