57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3764 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  374  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  51.83 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  48.97 
 
 		 194 aa  167  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  47.15 
 
 		 194 aa  167  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  47.59 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  45.45 
 
 		 190 aa  158  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  49.74 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  49.39 
 
 		 167 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  43.85 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  40.1 
 
 		 197 aa  130  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  45.26 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  40.32 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  39.79 
 
 		 180 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  40.34 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  40.59 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  41.08 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  38.51 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  39.25 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  39.25 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  39.25 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  35.11 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  31.52 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  34.2 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  32 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 437 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  35.23 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  30.18 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0172  hypothetical protein  39.66 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  31.18 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  34.25 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  34.66 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  31.91 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  31.09 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  31.09 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  31.87 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  31.98 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  28.3 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3298  hypothetical protein  41.67 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  30.27 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1377  hypothetical protein  40 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6121  hypothetical protein  27.6 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.0364143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4246  hypothetical protein  46.97 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0354747  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  35.84 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  31.18 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  28.11 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  38.16 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3356  hypothetical protein  31.55 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0403747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  29.63 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  25.37 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  29.05 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  27.59 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  29.27 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  27.87 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  29.89 
 
 		 230 aa  42  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2969  hypothetical protein  28.8 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0761659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  26.92 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>