170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0242 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0242  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  100 
 
 		 531 aa  1068    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14138  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2755  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  62.69 
 
 		 538 aa  636    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.018415  decreased coverage  0.00000370584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1145  carbohydrate kinase FGGY  59.05 
 
 		 532 aa  689    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0496  carbohydrate kinase FGGY  60.71 
 
 		 539 aa  625  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.906538 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3468  carbohydrate kinase FGGY  54.46 
 
 		 535 aa  624  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0401  carbohydrate kinase FGGY  64.5 
 
 		 537 aa  619  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0480  carbohydrate kinase, FGGY  52.41 
 
 		 540 aa  568  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.50905  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1020  putative L-ribulokinase  53.79 
 
 		 548 aa  569  1e-161  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0854  L-ribulokinase (putative)  50.19 
 
 		 539 aa  559  1e-158  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29500  pentulose/hexulose kinase  56.3 
 
 		 546 aa  560  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0034  sugar kinase  48.95 
 
 		 530 aa  548  1e-155  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0227  L-ribulokinase (putative)  50.76 
 
 		 532 aa  543  1e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42527  predicted protein  29.38 
 
 		 522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000294856  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  22.62 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  24.74 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  25 
 
 		 499 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0437  carbohydrate kinase FGGY  27.58 
 
 		 498 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000361421  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  27.38 
 
 		 512 aa  77.8  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  24.86 
 
 		 509 aa  76.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  24.31 
 
 		 493 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1605  carbohydrate kinase FGGY  24.62 
 
 		 490 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  25.61 
 
 		 493 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  23.25 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  23.47 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  31.78 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  21.89 
 
 		 500 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  30.47 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  31.78 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  30.47 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  27.02 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  26.74 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  29.91 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  29.91 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  29.91 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  29.91 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  22.33 
 
 		 510 aa  66.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2505  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  23.51 
 
 		 494 aa  66.6  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00721444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  24.19 
 
 		 515 aa  65.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  25 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  23.22 
 
 		 518 aa  65.1  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  25 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  25 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  25 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  26.88 
 
 		 496 aa  64.7  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  25 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  20.33 
 
 		 509 aa  63.9  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  27.56 
 
 		 486 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  27.14 
 
 		 548 aa  62.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  27.19 
 
 		 481 aa  62  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  24.91 
 
 		 494 aa  62  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  24.84 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  23.83 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  23.83 
 
 		 483 aa  60.1  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  28.45 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  27.9 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  27.9 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  25.82 
 
 		 480 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  24.61 
 
 		 499 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  23.18 
 
 		 495 aa  58.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  24.21 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  25.61 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  25.26 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  25.61 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  25.61 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  26.4 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  28.93 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  23.36 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  25.35 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  25.35 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  25.35 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  20.72 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  28.43 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  25.35 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  25.35 
 
 		 493 aa  57  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  26.3 
 
 		 493 aa  57  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  27.08 
 
 		 485 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  26.86 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  25.51 
 
 		 489 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  26.26 
 
 		 496 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  22.73 
 
 		 488 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  26.98 
 
 		 498 aa  55.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  24.63 
 
 		 505 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  26.01 
 
 		 502 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  24.81 
 
 		 506 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  20.98 
 
 		 501 aa  55.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  26.56 
 
 		 484 aa  55.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4109  carbohydrate kinase FGGY  23.64 
 
 		 494 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  27.08 
 
 		 488 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  25.39 
 
 		 484 aa  53.9  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  24.91 
 
 		 493 aa  53.9  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  28.43 
 
 		 492 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  28.43 
 
 		 492 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  22.19 
 
 		 517 aa  53.9  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  26.01 
 
 		 464 aa  53.5  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  23.65 
 
 		 498 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  27.04 
 
 		 488 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  21.93 
 
 		 517 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  26.04 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  22.38 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  23.01 
 
 		 511 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>