103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3006 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 344 aa  699    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  54.79 
 
 		 370 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  36.1 
 
 		 371 aa  210  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  33.43 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  32.58 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 		 254 aa  86.3  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 		 259 aa  86.3  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  27.05 
 
 		 259 aa  82  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  26.97 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  27.05 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  26.48 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  25.6 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  27.96 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  28.63 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  26.12 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  26.67 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  27.8 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2086  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  27.73 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 257 aa  67  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  26.38 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 		 275 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  27.57 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  26.34 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  25.63 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.48 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.48 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  26.43 
 
 		 571 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  25.83 
 
 		 393 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  21.77 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0614  beta-lactamase domain protein  21.88 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  25.67 
 
 		 403 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  24.51 
 
 		 395 aa  53.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  25 
 
 		 575 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  26.2 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  25.32 
 
 		 257 aa  53.1  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  25.13 
 
 		 423 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  24.55 
 
 		 576 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0320  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  24.38 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  24.47 
 
 		 409 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  26.88 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.93 
 
 		 575 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  24.02 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.93 
 
 		 575 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.87 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  22.51 
 
 		 393 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  23.95 
 
 		 574 aa  49.3  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1162  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  27.06 
 
 		 569 aa  49.3  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  23.81 
 
 		 582 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.15 
 
 		 574 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  33.04 
 
 		 570 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  24.69 
 
 		 884 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  26.25 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  23.83 
 
 		 404 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2889  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 		 410 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.726482  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  27.49 
 
 		 574 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  23.64 
 
 		 417 aa  46.2  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  21.79 
 
 		 431 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  23.95 
 
 		 395 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.55 
 
 		 575 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0174  ATPase domain-containing protein  22.65 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4139  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  26.32 
 
 		 601 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  23.95 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  25.77 
 
 		 406 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28461  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  24.4 
 
 		 591 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.751796 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  24.49 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  22.35 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1859  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.56 
 
 		 585 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0503  beta-lactamase domain-containing protein  22.4 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0527629  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00501  flavoprotein  24.24 
 
 		 591 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  23.11 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.51 
 
 		 575 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0044  flavoprotein  22.42 
 
 		 591 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  26.72 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  26.83 
 
 		 406 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  21.81 
 
 		 508 aa  43.5  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  24 
 
 		 576 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  26.03 
 
 		 391 aa  43.1  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  24.86 
 
 		 503 aa  43.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1438  flavin reductase-like, FMN-binding  26.06 
 
 		 597 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  23.33 
 
 		 404 aa  42.7  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>