More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1835 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  100 
 
 
277 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  59.78 
 
 
272 aa  305  6e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  59.12 
 
 
274 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  58.76 
 
 
274 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  61.76 
 
 
272 aa  299  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  61.4 
 
 
277 aa  289  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  60.15 
 
 
272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  40.94 
 
 
272 aa  185  8e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  40.08 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  42.58 
 
 
264 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  42.91 
 
 
280 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  37.91 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  40 
 
 
277 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  34.94 
 
 
276 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  42.25 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  37.92 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  40.08 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  36 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  36 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  44.36 
 
 
267 aa  161  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  37.55 
 
 
266 aa  161  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  35.74 
 
 
277 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  34.72 
 
 
272 aa  159  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  35.02 
 
 
277 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  35.02 
 
 
277 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  35.02 
 
 
277 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  35.02 
 
 
277 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  35.02 
 
 
277 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  35.02 
 
 
277 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  37.83 
 
 
277 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  35.02 
 
 
277 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  36.74 
 
 
284 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  37.89 
 
 
268 aa  156  3e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  37.28 
 
 
277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  41.31 
 
 
265 aa  155  6e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  35.83 
 
 
274 aa  152  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  39.69 
 
 
285 aa  152  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  38.64 
 
 
275 aa  151  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  38.11 
 
 
291 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0440  ABC-3 protein  34.31 
 
 
281 aa  149  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000628082  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  37.97 
 
 
289 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  39.38 
 
 
279 aa  149  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  36.09 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  38.89 
 
 
326 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  36.74 
 
 
269 aa  146  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  32.35 
 
 
275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  34.87 
 
 
268 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  35.19 
 
 
273 aa  145  9e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  38.46 
 
 
330 aa  145  9e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  37.36 
 
 
291 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  34.44 
 
 
273 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  34.34 
 
 
272 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  34.34 
 
 
272 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  36.98 
 
 
277 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  34.13 
 
 
269 aa  142  6e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  33.98 
 
 
268 aa  142  7e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  40.08 
 
 
339 aa  142  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  38.91 
 
 
272 aa  142  9e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  35.63 
 
 
337 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  38.37 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  37.96 
 
 
273 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  34.46 
 
 
289 aa  139  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  35.56 
 
 
273 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  32.72 
 
 
278 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  39.3 
 
 
273 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  35.4 
 
 
361 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  32.72 
 
 
278 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  34.25 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  41.31 
 
 
287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  32.35 
 
 
268 aa  136  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  29.74 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  35.89 
 
 
269 aa  133  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  33.08 
 
 
279 aa  133  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  37.26 
 
 
268 aa  133  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  36.4 
 
 
289 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  32.03 
 
 
267 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  35.87 
 
 
336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3478  ABC-3 protein  36.12 
 
 
405 aa  132  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1590  ABC-3 protein  37.98 
 
 
268 aa  132  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  35.14 
 
 
281 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  32.63 
 
 
267 aa  132  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  35.8 
 
 
273 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  36.65 
 
 
264 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  36.19 
 
 
357 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  36.68 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  33.33 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  35.06 
 
 
280 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  35.94 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0207  ABC-3 protein  40.89 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.135711  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  34.43 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  34.21 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  34.64 
 
 
276 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  32.46 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  32.23 
 
 
264 aa  125  6e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  35.11 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  31.84 
 
 
269 aa  125  8.000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  32.2 
 
 
280 aa  125  9e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0853  ABC-3 protein  37.5 
 
 
352 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>