More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1541 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2223  Beta-ketoacyl synthase  37.19 
 
 
2468 aa  704    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  39.91 
 
 
2545 aa  1620    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  51.17 
 
 
2543 aa  2453    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1945  Beta-ketoacyl synthase  34.93 
 
 
2484 aa  1255    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1947  Beta-ketoacyl synthase  37.28 
 
 
2468 aa  704    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  40.02 
 
 
2546 aa  1605    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  40.02 
 
 
2546 aa  1605    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  36.44 
 
 
2230 aa  671    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3805  Beta-ketoacyl synthase  39.15 
 
 
2460 aa  695    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.780265  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  41.94 
 
 
1144 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  40.06 
 
 
2546 aa  1606    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  39.4 
 
 
2545 aa  1623    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.93 
 
 
1832 aa  707    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  47.6 
 
 
2543 aa  729    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  36.66 
 
 
1939 aa  714    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0317  Beta-ketoacyl synthase  38.81 
 
 
2476 aa  730    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.567588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  36.11 
 
 
3111 aa  713    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  37.61 
 
 
2333 aa  716    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  37.33 
 
 
3101 aa  716    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0197  Beta-ketoacyl synthase  33.5 
 
 
2500 aa  1234    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  39.93 
 
 
2544 aa  1620    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4330  polyketide synthetase protein  35.77 
 
 
2523 aa  668    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  43.74 
 
 
2486 aa  1989    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  29.45 
 
 
2551 aa  1025    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  36.98 
 
 
2232 aa  686    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1113  Beta-ketoacyl synthase  35.14 
 
 
2492 aa  1272    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14838  normal  0.128141 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.2 
 
 
1804 aa  695    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  39.93 
 
 
2544 aa  1621    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  43.74 
 
 
2486 aa  1989    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  38.9 
 
 
2507 aa  818    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1146  Beta-ketoacyl synthase  38.4 
 
 
2556 aa  935    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1838  Beta-ketoacyl synthase  34.4 
 
 
2468 aa  1230    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0952  Beta-ketoacyl synthase  39.02 
 
 
2485 aa  742    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  40.02 
 
 
2546 aa  1605    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  40.02 
 
 
2546 aa  1605    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  39.95 
 
 
2546 aa  1601    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  40.06 
 
 
2546 aa  1607    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  49.47 
 
 
2499 aa  2315    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2723  Beta-ketoacyl synthase  38.56 
 
 
2492 aa  696    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
2547 aa  5229    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0640  Beta-ketoacyl synthase  37.34 
 
 
2352 aa  632  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.5 
 
 
1822 aa  628  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.98 
 
 
1867 aa  625  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  34.21 
 
 
7210 aa  621  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  34.86 
 
 
3930 aa  616  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.03 
 
 
2136 aa  612  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
1874 aa  611  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
7110 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  34.17 
 
 
3449 aa  612  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  32.48 
 
 
2126 aa  612  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40.14 
 
 
1656 aa  609  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  34.76 
 
 
2890 aa  608  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  33.47 
 
 
1966 aa  602  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  33.85 
 
 
2225 aa  601  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  34.19 
 
 
4183 aa  597  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  34.2 
 
 
3080 aa  596  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.32 
 
 
3176 aa  595  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  34 
 
 
7279 aa  594  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  34.62 
 
 
2719 aa  591  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  35.49 
 
 
1827 aa  591  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  32.93 
 
 
3508 aa  588  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  35.05 
 
 
3645 aa  590  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  33.79 
 
 
4151 aa  589  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  34.08 
 
 
2966 aa  584  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  39.12 
 
 
2880 aa  582  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  34.56 
 
 
3158 aa  581  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  34.03 
 
 
1805 aa  582  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
2551 aa  577  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  33.01 
 
 
5255 aa  575  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  33.22 
 
 
1789 aa  573  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  32.4 
 
 
2085 aa  573  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  32.4 
 
 
2085 aa  573  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  34.06 
 
 
3493 aa  570  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  32.6 
 
 
3693 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  32.6 
 
 
3693 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  33.66 
 
 
3494 aa  568  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  32.95 
 
 
3702 aa  569  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  37.75 
 
 
1263 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
5400 aa  566  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  32.32 
 
 
2220 aa  566  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  32.18 
 
 
1831 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  34.31 
 
 
3463 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  32.74 
 
 
3676 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  32.23 
 
 
2085 aa  567  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  35.9 
 
 
1087 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  37.27 
 
 
1587 aa  561  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  38.89 
 
 
1823 aa  563  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  36.6 
 
 
1354 aa  562  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  37.78 
 
 
2162 aa  561  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 
5154 aa  559  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  36.94 
 
 
1114 aa  557  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  38.56 
 
 
1828 aa  560  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  32.32 
 
 
2277 aa  557  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  34.19 
 
 
2090 aa  557  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  39.49 
 
 
1577 aa  555  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  32.66 
 
 
4080 aa  555  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  32.48 
 
 
2020 aa  557  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  33.84 
 
 
3670 aa  553  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  31.53 
 
 
1349 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  39.37 
 
 
1581 aa  553  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>