More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0945 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  100 
 
 
511 aa  1048    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  48.65 
 
 
509 aa  500  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  48.46 
 
 
509 aa  498  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  51.98 
 
 
523 aa  491  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  51.24 
 
 
523 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0298  putative flavoprotein subunit of a reductase  35.69 
 
 
508 aa  286  8e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  37.62 
 
 
507 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26410  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  33.61 
 
 
546 aa  242  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13800  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  31.99 
 
 
547 aa  226  9e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.57 
 
 
519 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1365  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33 
 
 
628 aa  212  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07260  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  29.57 
 
 
472 aa  199  9e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  32.58 
 
 
464 aa  182  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  31.43 
 
 
589 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3021  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.99 
 
 
552 aa  178  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.867777  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07280  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  30.08 
 
 
575 aa  177  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2930  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.38 
 
 
512 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1103  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.78 
 
 
598 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  29.4 
 
 
597 aa  171  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.61 
 
 
543 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0172  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.22 
 
 
560 aa  167  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.79854  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  30.24 
 
 
591 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.72 
 
 
502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.11 
 
 
457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.94 
 
 
527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.24 
 
 
572 aa  164  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.221964 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2291  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.25 
 
 
565 aa  161  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0288  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.9 
 
 
557 aa  160  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  28.06 
 
 
925 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.01 
 
 
616 aa  159  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2796  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.8 
 
 
578 aa  159  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000175303 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.66 
 
 
482 aa  159  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  28.52 
 
 
657 aa  158  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  30.54 
 
 
491 aa  156  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12690  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.69 
 
 
580 aa  156  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  28.76 
 
 
504 aa  155  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  31.14 
 
 
1004 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  28.05 
 
 
637 aa  154  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  28.15 
 
 
608 aa  152  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  30.53 
 
 
609 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  29.25 
 
 
598 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0977  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.84 
 
 
561 aa  152  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0367  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.79 
 
 
589 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.786243 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0986  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.1 
 
 
567 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  27.64 
 
 
1005 aa  147  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.55 
 
 
534 aa  147  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  29.94 
 
 
596 aa  147  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.53 
 
 
596 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1624  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.68 
 
 
524 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  29.58 
 
 
519 aa  146  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  29.74 
 
 
596 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0596  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.36 
 
 
588 aa  144  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.721596 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  29.28 
 
 
597 aa  144  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  29.53 
 
 
596 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  27.5 
 
 
599 aa  143  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12630  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  28.51 
 
 
545 aa  143  7e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  26.82 
 
 
925 aa  143  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  29.96 
 
 
582 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  29.12 
 
 
596 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  29.12 
 
 
596 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  29.12 
 
 
596 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  29.12 
 
 
596 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  29.76 
 
 
582 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.07 
 
 
463 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  29.71 
 
 
586 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.81 
 
 
465 aa  141  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0182  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.45 
 
 
588 aa  140  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.31 
 
 
562 aa  140  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.770057 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0342  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.06 
 
 
557 aa  140  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0195755  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0183  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.76 
 
 
592 aa  140  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.83 
 
 
503 aa  139  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.82 
 
 
576 aa  139  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01750  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.57 
 
 
597 aa  138  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000634922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  28.78 
 
 
586 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  28.15 
 
 
596 aa  137  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  27.96 
 
 
957 aa  137  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  27.59 
 
 
596 aa  137  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2698  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.46 
 
 
591 aa  137  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  28.65 
 
 
584 aa  136  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1779  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.7 
 
 
586 aa  136  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  30.36 
 
 
582 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2533  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.56 
 
 
555 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.72 
 
 
491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  27.74 
 
 
631 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2817  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.89 
 
 
582 aa  134  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0130426 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2354  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.8 
 
 
551 aa  134  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  28.77 
 
 
519 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  27.83 
 
 
511 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  27.05 
 
 
588 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1533  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.72 
 
 
485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.339209 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.31 
 
 
522 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  24.62 
 
 
926 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13560  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.46 
 
 
549 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  27.1 
 
 
596 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  29.76 
 
 
582 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  27.37 
 
 
583 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  29.76 
 
 
582 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  26.01 
 
 
650 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  28.68 
 
 
519 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  26.28 
 
 
616 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>