More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2885 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 593 aa  1124    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  50.99 
 
 		 591 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.36 
 
 		 831 aa  243  7e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1402 aa  225  2e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  30.85 
 
 		 684 aa  223  7e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  29.03 
 
 		 961 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  31.44 
 
 		 557 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  35.44 
 
 		 489 aa  190  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  30.05 
 
 		 685 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 1032 aa  178  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  30.13 
 
 		 490 aa  173  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  29.91 
 
 		 490 aa  171  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  29.61 
 
 		 789 aa  171  4e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  34.29 
 
 		 393 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.48 
 
 		 528 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  29.78 
 
 		 1037 aa  165  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  30.86 
 
 		 679 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  29.17 
 
 		 680 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 976 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1493 aa  147  5e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.45 
 
 		 341 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  30.06 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  30.06 
 
 		 376 aa  137  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  36.44 
 
 		 505 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  29.61 
 
 		 425 aa  135  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1438  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.31 
 
 		 517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.636598 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  30 
 
 		 464 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.38 
 
 		 380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  35.07 
 
 		 961 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1877 aa  128  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3565  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.58 
 
 		 418 aa  126  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.61 
 
 		 392 aa  126  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.35 
 
 		 865 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  29.29 
 
 		 305 aa  125  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  30.19 
 
 		 552 aa  123  7e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.15 
 
 		 487 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  34.86 
 
 		 358 aa  120  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  28.87 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.28 
 
 		 343 aa  119  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  32.91 
 
 		 399 aa  118  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  26.95 
 
 		 509 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  32.85 
 
 		 380 aa  118  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  26.86 
 
 		 509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  31.27 
 
 		 380 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  26.86 
 
 		 509 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  26.71 
 
 		 509 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.35 
 
 		 346 aa  114  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.78 
 
 		 565 aa  114  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  31.63 
 
 		 416 aa  114  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.94 
 
 		 318 aa  110  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1002 aa  108  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  37.76 
 
 		 478 aa  107  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 		 1430 aa  107  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  26.77 
 
 		 348 aa  106  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  30.81 
 
 		 359 aa  106  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.88 
 
 		 890 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  23.14 
 
 		 1078 aa  105  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  23.37 
 
 		 1044 aa  105  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  33.77 
 
 		 271 aa  104  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.33 
 
 		 2413 aa  103  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 303 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3674  enhanced entry protein  36.73 
 
 		 540 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  35.5 
 
 		 256 aa  101  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  27.36 
 
 		 523 aa  101  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  34.31 
 
 		 255 aa  101  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.02 
 
 		 232 aa  99.8  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  29.29 
 
 		 331 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1366 aa  99.4  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.78 
 
 		 272 aa  99.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 		 252 aa  99.4  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.49 
 
 		 512 aa  99.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.56 
 
 		 270 aa  98.6  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  24.93 
 
 		 373 aa  98.2  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  24.93 
 
 		 373 aa  97.1  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.14 
 
 		 325 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  32.21 
 
 		 267 aa  97.1  8e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.69 
 
 		 360 aa  97.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  30.14 
 
 		 325 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.66 
 
 		 316 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  28.26 
 
 		 329 aa  96.3  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  34.03 
 
 		 235 aa  94.7  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  36.6 
 
 		 384 aa  94.7  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.69 
 
 		 360 aa  94.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  36.25 
 
 		 245 aa  94.7  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  27.36 
 
 		 850 aa  94.4  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  31.73 
 
 		 285 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  37.56 
 
 		 415 aa  92  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  34.91 
 
 		 337 aa  91.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  23.79 
 
 		 693 aa  91.7  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.59 
 
 		 248 aa  91.3  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.59 
 
 		 248 aa  90.9  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.02 
 
 		 321 aa  90.1  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  24.55 
 
 		 331 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  34.19 
 
 		 241 aa  89  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.12 
 
 		 222 aa  89.4  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  28.33 
 
 		 325 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  37.59 
 
 		 236 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  36.42 
 
 		 185 aa  88.6  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.88 
 
 		 798 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>