More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3561 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  100 
 
 		 387 aa  773    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  66.22 
 
 		 391 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  64.52 
 
 		 378 aa  474  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  58.67 
 
 		 388 aa  422  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1729  Citrate (Si)-synthase  55.14 
 
 		 373 aa  358  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  41.94 
 
 		 395 aa  276  5e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  42.43 
 
 		 375 aa  266  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  43.24 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  42.09 
 
 		 377 aa  256  6e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.68 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.8 
 
 		 390 aa  239  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.14 
 
 		 397 aa  239  5.999999999999999e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  39.95 
 
 		 374 aa  235  8e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  37.27 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.57 
 
 		 378 aa  233  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.56 
 
 		 385 aa  232  8.000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.59 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.87 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0247  citrate synthase 2  37.53 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  38.02 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  36.29 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.79 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.79 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  36.29 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.3 
 
 		 379 aa  227  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.41 
 
 		 382 aa  226  6e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  36.2 
 
 		 372 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  37.8 
 
 		 371 aa  226  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.42 
 
 		 377 aa  224  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  36.27 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0848  Citrate (Si)-synthase  36.81 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.96 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  34.78 
 
 		 375 aa  223  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.93 
 
 		 379 aa  224  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0520  citrate (Si)-synthase  37.23 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.341938  normal  0.0162418 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.7 
 
 		 380 aa  223  4.9999999999999996e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  35.18 
 
 		 375 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  36.24 
 
 		 374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.5 
 
 		 382 aa  223  6e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  35.18 
 
 		 375 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0142  methylcitrate synthase  36.49 
 
 		 390 aa  222  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0733  citrate synthase 2  37.89 
 
 		 368 aa  222  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.6 
 
 		 409 aa  222  8e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  35.18 
 
 		 375 aa  222  8e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  34.56 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0878  methylcitrate synthase  35.99 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1869  methylcitrate synthase  35.99 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  36.49 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1737  methylcitrate synthase  35.99 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2142  methylcitrate synthase  35.99 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1165  methylcitrate synthase  35.99 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0289  methylcitrate synthase  35.99 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0383  methylcitrate synthase  35.99 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  36.14 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3288  methylcitrate synthase  36.63 
 
 		 390 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281405  normal  0.014196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0834  Citrate (Si)-synthase  37.6 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2188  methylcitrate synthase  35.71 
 
 		 390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5388  methylcitrate synthase  35.42 
 
 		 390 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02719  methylcitrate synthase  35.6 
 
 		 384 aa  219  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4841  methylcitrate synthase  35.42 
 
 		 390 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.994856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4756  methylcitrate synthase  36.1 
 
 		 390 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.394349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5345  methylcitrate synthase  36.1 
 
 		 390 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5516  methylcitrate synthase  36.1 
 
 		 390 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  35.41 
 
 		 370 aa  219  8.999999999999998e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  34.85 
 
 		 381 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  34.85 
 
 		 381 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  35.96 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  35.66 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2081  methylcitrate synthase  36.68 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847456  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  35.33 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.66 
 
 		 382 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.03 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  34.58 
 
 		 381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  35.52 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10908  citrate synthase 2  38.24 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6081  methylcitrate synthase  34.79 
 
 		 389 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.662054 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  36.31 
 
 		 378 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2647  methylcitrate synthase  36.26 
 
 		 394 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.69 
 
 		 374 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5814  Citrate (Si)-synthase  38.99 
 
 		 361 aa  216  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2480  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.93 
 
 		 380 aa  216  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0357  methylcitrate synthase  36.59 
 
 		 389 aa  216  7e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  35.66 
 
 		 374 aa  216  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.16 
 
 		 374 aa  216  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.42 
 
 		 374 aa  215  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  36.2 
 
 		 397 aa  216  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  33.69 
 
 		 374 aa  215  9e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  34.77 
 
 		 375 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3273  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.74 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1016  Citrate (Si)-synthase  36.8 
 
 		 366 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  34.77 
 
 		 375 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  34.77 
 
 		 375 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3292  methylcitrate synthase  36.74 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0404  methylcitrate synthase  36.59 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0364  methylcitrate synthase  36.59 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  34.77 
 
 		 375 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  34.77 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1868  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.69 
 
 		 376 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.650369  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  35.58 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1809  methylcitrate synthase  34.78 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>