More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0963 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 300 aa  598  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  65.19 
 
 		 290 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  65.86 
 
 		 288 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  65.86 
 
 		 288 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  65.86 
 
 		 288 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  63.19 
 
 		 304 aa  354  7.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  64.04 
 
 		 291 aa  349  4e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  61.69 
 
 		 293 aa  348  6e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  62.2 
 
 		 303 aa  343  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  63.85 
 
 		 329 aa  343  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  58.04 
 
 		 296 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  55.9 
 
 		 291 aa  308  8e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  54.01 
 
 		 291 aa  298  7e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  58.59 
 
 		 300 aa  296  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  55.56 
 
 		 287 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  55.9 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  53.38 
 
 		 291 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  55.21 
 
 		 299 aa  281  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  55.59 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  55.59 
 
 		 320 aa  272  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  52.45 
 
 		 288 aa  272  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  54.06 
 
 		 300 aa  271  9e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  54.9 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  51.57 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  52.4 
 
 		 313 aa  259  5.0000000000000005e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  51.24 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  49.12 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  49.34 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  51.04 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  47.62 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  47.48 
 
 		 311 aa  232  6e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  50.88 
 
 		 581 aa  228  9e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  47.95 
 
 		 315 aa  226  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  48.81 
 
 		 303 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  47.44 
 
 		 335 aa  223  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  41.03 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  50 
 
 		 313 aa  216  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  39.59 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  43.01 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  43.13 
 
 		 360 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  40.62 
 
 		 318 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  40.78 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  37.5 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  36.93 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  41.59 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0131  A/G-specific adenine glycosylase  33.92 
 
 		 342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.12 
 
 		 368 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.52 
 
 		 361 aa  142  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  40.69 
 
 		 360 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.74 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  36 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.96 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.67 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  38.71 
 
 		 365 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  37.68 
 
 		 351 aa  139  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  39.71 
 
 		 355 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  38.73 
 
 		 355 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  37.78 
 
 		 354 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  35.74 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  36.8 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  40.47 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 381 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  38.01 
 
 		 357 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  39.22 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  37.74 
 
 		 388 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  40.91 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  38.73 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  32.76 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43811  predicted protein  38.01 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  39.22 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.69 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.45 
 
 		 375 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  36.96 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  36.64 
 
 		 401 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  39.91 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  34.78 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.71 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  40.87 
 
 		 368 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  36.68 
 
 		 358 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  40.87 
 
 		 368 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.38 
 
 		 353 aa  136  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  39.52 
 
 		 354 aa  136  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  40.87 
 
 		 368 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  38.01 
 
 		 368 aa  136  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  38.24 
 
 		 355 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  37 
 
 		 615 aa  136  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.36 
 
 		 368 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  33.74 
 
 		 353 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  40.43 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  37.75 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  40.43 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  40.43 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  40.43 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.29 
 
 		 368 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.56 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  39.72 
 
 		 363 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  39.55 
 
 		 384 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.25 
 
 		 372 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  39.72 
 
 		 363 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>