More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0251 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 253 aa  505  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  70.98 
 
 		 256 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  70.98 
 
 		 256 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  70.98 
 
 		 256 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  70.75 
 
 		 254 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  67.18 
 
 		 260 aa  340  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  66.41 
 
 		 260 aa  339  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.39 
 
 		 254 aa  334  7e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  62.06 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 		 257 aa  218  7e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  44.09 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 		 249 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  41.63 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 		 247 aa  148  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  39.09 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  32.52 
 
 		 245 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 		 243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 		 248 aa  111  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  31.15 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  30.36 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  28.86 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.42 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  32.13 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.05 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  29.44 
 
 		 240 aa  102  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  32.02 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  29.51 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  28.28 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  27.94 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.51 
 
 		 249 aa  95.1  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 		 245 aa  92  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.94 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  30.91 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.56 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.57 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.24 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  27.95 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  27.49 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.59 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.841301 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.36 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00800542  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  28.29 
 
 		 250 aa  62  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  27.38 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  26.98 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  27.38 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  26.98 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  26.98 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  26.98 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.35 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  26.98 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.4 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0685  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.47 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  28.3 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2411  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.66 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl172  dehydrogenase  29.52 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0518  short chain dehydrogenase  29.18 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0528  short chain dehydrogenase  29.18 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0540  short chain dehydrogenase  29.18 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0506548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  28.16 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0470  short chain dehydrogenase  26.69 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3014  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.73 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.698047  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3237  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.18 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.85457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  26.59 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.77 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>