More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3167 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 302 aa  616  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  71.13 
 
 		 299 aa  431  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  65.74 
 
 		 298 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  32.11 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  31.8 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  33.58 
 
 		 319 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  33.98 
 
 		 319 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  31.12 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 		 315 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  33.91 
 
 		 319 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  33.91 
 
 		 319 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  35.62 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  38.95 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  31.58 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 		 321 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  27.38 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  29.96 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  33.75 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  39.58 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  30.35 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  30.35 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  30.35 
 
 		 335 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  30.35 
 
 		 335 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 336 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  30.08 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  31.7 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 339 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  31.67 
 
 		 319 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  31.38 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  29.64 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.88 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 320 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  29.92 
 
 		 333 aa  115  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  30.13 
 
 		 438 aa  115  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  29.66 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  31.53 
 
 		 305 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  32.65 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  31.56 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 		 332 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  29.96 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  29.96 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  29.96 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  27.11 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  29.96 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  30.97 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  29.96 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  29.96 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  29.96 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  32.85 
 
 		 271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  28.21 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  26.15 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  28.4 
 
 		 637 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  33 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.19 
 
 		 318 aa  106  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  28.27 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 		 342 aa  105  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  28.87 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  31.05 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  27.53 
 
 		 644 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  27.61 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  28.84 
 
 		 264 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.47 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  34.38 
 
 		 364 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  28.63 
 
 		 362 aa  99.8  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  26.09 
 
 		 334 aa  99.4  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  25.68 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>