More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0985 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0985  sporulation integral membrane protein YtvI  100 
 
 
341 aa  665    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2466  sporulation integral membrane protein YtvI  74.7 
 
 
343 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.180742  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2924  sporulation integral membrane protein YtvI  36.61 
 
 
354 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  33.53 
 
 
372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1971  hypothetical protein  30.72 
 
 
362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  33.94 
 
 
372 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  33.94 
 
 
365 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  33.64 
 
 
372 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  33.64 
 
 
372 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  32.96 
 
 
372 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  33.63 
 
 
372 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  33.63 
 
 
372 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  33.63 
 
 
365 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  32.96 
 
 
372 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3205  sporulation integral membrane protein YtvI  30.87 
 
 
362 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000954806  hitchhiker  0.000000642415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4426  sporulation integral membrane protein YtvI  32.96 
 
 
372 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1040  hypothetical protein  29.47 
 
 
366 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00428171  unclonable  0.0000000129007 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  29.32 
 
 
358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0024  hypothetical protein  30.65 
 
 
355 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2683  sporulation integral membrane protein YtvI  31.83 
 
 
372 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0571053  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3372  sporulation integral membrane protein YtvI  26.73 
 
 
353 aa  149  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0779  sporulation integral membrane protein YtvI  33.33 
 
 
372 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0189  sporulation integral membrane protein YtvI  27.43 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1013  hypothetical protein  29.27 
 
 
360 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000395023  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0888  hypothetical protein  27.73 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000401846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0115  sporulation integral membrane protein YtvI  26.35 
 
 
356 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00027098  hitchhiker  0.00391046 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2429  hypothetical protein  28.48 
 
 
356 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3703  sporulation integral membrane protein YtvI  32.72 
 
 
365 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000243637  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0585  sporulation integral membrane protein YtvI  31.66 
 
 
351 aa  116  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3838  sporulation integral membrane protein YtvI  26.18 
 
 
344 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0429  sporulation integral membrane protein YtvI  25.97 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07720  Sporulation integral membrane protein YtvI  26.07 
 
 
355 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3488  sporulation integral membrane protein YtvI  24.45 
 
 
374 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000381599  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0628  sporulation integral membrane protein YtvI  27.48 
 
 
367 aa  102  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1173  protein of unknown function UPF0118  24.46 
 
 
386 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2662  sporulation integral membrane protein YtvI  24.15 
 
 
354 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0427  sporulation integral membrane protein YtvI  26.33 
 
 
371 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  22.73 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  24.71 
 
 
452 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  21.24 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  24.52 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  21.65 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  25.39 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  23.73 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2984  sporulation integral membrane protein YtvI  22.5 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  23.3 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  21.84 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  22.54 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  22.78 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.25 
 
 
351 aa  67  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.07 
 
 
388 aa  66.2  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  22.59 
 
 
374 aa  65.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  23.03 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  25.47 
 
 
362 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  25.47 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  25.47 
 
 
362 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  25.47 
 
 
362 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  25.47 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  26.38 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  23.59 
 
 
373 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  22.26 
 
 
374 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05090  predicted permease  22.44 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.114877  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  24.55 
 
 
345 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  23.49 
 
 
358 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  23.26 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  22.3 
 
 
373 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  21.99 
 
 
376 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  21.99 
 
 
376 aa  63.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  21.99 
 
 
376 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  21.99 
 
 
376 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  21.99 
 
 
373 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  24.28 
 
 
345 aa  62.8  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  23.46 
 
 
370 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  26.03 
 
 
355 aa  62.8  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  22.64 
 
 
353 aa  62.8  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  22.99 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  21.97 
 
 
376 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  21.97 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  23.78 
 
 
354 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  23.78 
 
 
354 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  23.78 
 
 
354 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  22.22 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  26.03 
 
 
389 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  25.24 
 
 
423 aa  60.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  23.38 
 
 
321 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  20.97 
 
 
368 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  24.19 
 
 
426 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  21.45 
 
 
405 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  22.84 
 
 
353 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  21.79 
 
 
378 aa  60.1  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  20.97 
 
 
372 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  22.39 
 
 
403 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  23.97 
 
 
350 aa  59.7  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  22.02 
 
 
417 aa  59.3  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  22.8 
 
 
392 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  23.55 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  23.69 
 
 
366 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2069  hypothetical protein  23.72 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0264155 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  24.85 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>