More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3442 on replicon NC_012794
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  65.98 
 
 		 589 aa  821    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  65.64 
 
 		 587 aa  801    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 592 aa  1217    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  54.77 
 
 		 799 aa  634  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  48.59 
 
 		 569 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  47.51 
 
 		 580 aa  537  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  47.34 
 
 		 675 aa  531  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  45.02 
 
 		 611 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  44.29 
 
 		 586 aa  489  1e-137  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  43.73 
 
 		 583 aa  480  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  44.28 
 
 		 607 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  49.38 
 
 		 673 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  48.03 
 
 		 680 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  39.45 
 
 		 655 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  38.64 
 
 		 661 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  37.98 
 
 		 644 aa  436  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  45.09 
 
 		 661 aa  434  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  42.91 
 
 		 670 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  46.03 
 
 		 673 aa  427  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  37.29 
 
 		 676 aa  423  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  44.93 
 
 		 708 aa  425  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  44.61 
 
 		 676 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  44.61 
 
 		 676 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  45.22 
 
 		 663 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  45.11 
 
 		 658 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  39.8 
 
 		 608 aa  410  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  44.03 
 
 		 552 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  39.97 
 
 		 636 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  38.59 
 
 		 647 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  41.42 
 
 		 806 aa  409  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  43.9 
 
 		 683 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  43.77 
 
 		 783 aa  403  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  44.07 
 
 		 659 aa  405  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  44.07 
 
 		 661 aa  405  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  44.21 
 
 		 661 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  42.86 
 
 		 728 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  43.19 
 
 		 793 aa  398  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  42.57 
 
 		 777 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  43.47 
 
 		 787 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  42.71 
 
 		 686 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  42.88 
 
 		 794 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  40.97 
 
 		 709 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  42.31 
 
 		 725 aa  391  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  43.7 
 
 		 829 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  42.32 
 
 		 677 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  42.58 
 
 		 725 aa  367  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  40.27 
 
 		 793 aa  365  1e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  41.25 
 
 		 790 aa  364  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  42.26 
 
 		 710 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  40.04 
 
 		 778 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  34.42 
 
 		 675 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  40.41 
 
 		 763 aa  353  4e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  37.83 
 
 		 659 aa  333  7.000000000000001e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  32.09 
 
 		 675 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  36.51 
 
 		 691 aa  298  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  43.01 
 
 		 316 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  31.02 
 
 		 697 aa  205  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  51.31 
 
 		 371 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  27.87 
 
 		 574 aa  157  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.31 
 
 		 587 aa  156  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  29.08 
 
 		 574 aa  155  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  30.58 
 
 		 585 aa  152  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  28.33 
 
 		 574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  26.01 
 
 		 516 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  29.72 
 
 		 505 aa  144  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  28.8 
 
 		 822 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  25.33 
 
 		 522 aa  140  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  26.61 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  27.02 
 
 		 526 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  26.86 
 
 		 633 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  28.87 
 
 		 501 aa  138  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  27.6 
 
 		 508 aa  137  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  27.6 
 
 		 523 aa  137  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  27.99 
 
 		 496 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  26.65 
 
 		 511 aa  137  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  28.09 
 
 		 908 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  32.97 
 
 		 356 aa  135  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  25.75 
 
 		 547 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  28.72 
 
 		 824 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  26.86 
 
 		 510 aa  133  7.999999999999999e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.76 
 
 		 508 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  25.85 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  27.48 
 
 		 499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  25.85 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  27.15 
 
 		 505 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0697  N-6 DNA methylase  27.46 
 
 		 530 aa  130  7.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1594  N-6 DNA methylase  27.46 
 
 		 530 aa  130  7.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.153041  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  26.8 
 
 		 499 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  26.7 
 
 		 523 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  26.42 
 
 		 863 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  28.21 
 
 		 496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  28.47 
 
 		 808 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  27.08 
 
 		 527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  26.44 
 
 		 498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  28.17 
 
 		 814 aa  129  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  26.37 
 
 		 495 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  25.66 
 
 		 494 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  27.69 
 
 		 499 aa  128  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  27.23 
 
 		 493 aa  128  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  25.6 
 
 		 508 aa  128  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>