More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1594 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0697  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 530 aa  1092    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1594  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 530 aa  1092    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.153041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  28.21 
 
 		 676 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  28.21 
 
 		 676 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  26.9 
 
 		 673 aa  144  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  25.35 
 
 		 611 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  26.1 
 
 		 661 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  25.66 
 
 		 673 aa  139  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  25.94 
 
 		 658 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  25.87 
 
 		 661 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  24.13 
 
 		 580 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.34 
 
 		 644 aa  133  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  25.98 
 
 		 659 aa  133  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  25.31 
 
 		 670 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  28.06 
 
 		 686 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  30.6 
 
 		 583 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  28.54 
 
 		 683 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 		 777 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.53 
 
 		 663 aa  131  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  25.35 
 
 		 661 aa  131  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  29.55 
 
 		 680 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.06 
 
 		 676 aa  130  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  27.46 
 
 		 592 aa  130  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  27.68 
 
 		 806 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  29.68 
 
 		 607 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  26.29 
 
 		 655 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  29.5 
 
 		 708 aa  127  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  30.15 
 
 		 569 aa  127  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  25.23 
 
 		 675 aa  127  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  29.5 
 
 		 783 aa  127  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  27.82 
 
 		 794 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  29.28 
 
 		 728 aa  124  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  27.11 
 
 		 793 aa  121  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  29.28 
 
 		 725 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  27.32 
 
 		 501 aa  120  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  26.91 
 
 		 589 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  28.31 
 
 		 677 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  27.2 
 
 		 501 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  28.85 
 
 		 608 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.86 
 
 		 503 aa  119  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  28.34 
 
 		 552 aa  117  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  25.96 
 
 		 763 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  25.06 
 
 		 709 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  27.63 
 
 		 587 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  26.23 
 
 		 710 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  26.05 
 
 		 810 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  26.35 
 
 		 787 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  27.54 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  24.86 
 
 		 793 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  26.11 
 
 		 510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  27.17 
 
 		 829 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  23.62 
 
 		 661 aa  114  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  23.91 
 
 		 544 aa  113  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  26.52 
 
 		 636 aa  110  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  24.58 
 
 		 790 aa  109  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  27.15 
 
 		 540 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  24.87 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  25.86 
 
 		 517 aa  108  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  27.2 
 
 		 527 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  25.44 
 
 		 871 aa  107  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.8 
 
 		 586 aa  107  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  27.3 
 
 		 675 aa  107  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  28.62 
 
 		 544 aa  106  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  28.41 
 
 		 647 aa  106  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  25.57 
 
 		 544 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  25.81 
 
 		 568 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.04 
 
 		 538 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  27.74 
 
 		 675 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  26.24 
 
 		 564 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  28.85 
 
 		 498 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  24.26 
 
 		 527 aa  104  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  26.88 
 
 		 515 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  26.79 
 
 		 725 aa  103  9e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 810 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  22.8 
 
 		 691 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  26.49 
 
 		 799 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  26.77 
 
 		 569 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  25.48 
 
 		 814 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  27.13 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.08 
 
 		 497 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4393  type I restriction-modification system, M subunit  26.98 
 
 		 515 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3470  type I restriction-modification system, M subunit  26.06 
 
 		 523 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  26.51 
 
 		 519 aa  101  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  26.05 
 
 		 659 aa  101  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  23.78 
 
 		 847 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  29.01 
 
 		 499 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  24.63 
 
 		 505 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  25.33 
 
 		 517 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1953  type I restriction-modification system, M subunit  25.8 
 
 		 523 aa  99.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.710513  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  26.44 
 
 		 510 aa  99.8  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  24.45 
 
 		 574 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  24.51 
 
 		 809 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2253  type I restriction-modification system, M subunit  25.07 
 
 		 523 aa  99  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  24.81 
 
 		 495 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  25.52 
 
 		 697 aa  98.6  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  25.42 
 
 		 535 aa  98.2  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  27.85 
 
 		 568 aa  98.2  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  23.55 
 
 		 506 aa  98.6  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  29.35 
 
 		 570 aa  98.6  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  23.88 
 
 		 540 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>