More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2058 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2058  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 292 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.762247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1316  5'-3' exonuclease  54.85 
 
 		 288 aa  322  7e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000236171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1504  5'-3' exonuclease  55.22 
 
 		 288 aa  321  9.000000000000001e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1675  5'-3' exonuclease family protein  54.85 
 
 		 288 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3702  5'-3' exonuclease family protein  55.02 
 
 		 288 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00175288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1643  5'-3' exonuclease family protein  55.22 
 
 		 288 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0209002  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1461  5'-3' exonuclease  54.85 
 
 		 288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1489  5'-3' exonuclease family protein  54.48 
 
 		 288 aa  319  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1462  5'-3' exonuclease  54.48 
 
 		 288 aa  319  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1606  5'-3' exonuclease family protein  54.48 
 
 		 288 aa  319  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.368882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1754  5'-3' exonuclease family protein  54.85 
 
 		 288 aa  319  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0435319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1707  5'-3' exonuclease  54.48 
 
 		 288 aa  318  7e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00574418  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1529  5'-3' exonuclease  51.19 
 
 		 292 aa  296  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1500  5'-3' exonuclease  51.19 
 
 		 292 aa  296  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1012  5'-3' exonuclease, putative  50.4 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.667651  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  39.93 
 
 		 866 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  39.93 
 
 		 866 aa  215  8e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  42.2 
 
 		 876 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  43.3 
 
 		 866 aa  208  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  40 
 
 		 870 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  39.79 
 
 		 895 aa  206  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  39.52 
 
 		 850 aa  205  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  41.26 
 
 		 885 aa  205  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  41.85 
 
 		 878 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  38.54 
 
 		 917 aa  203  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  38.85 
 
 		 872 aa  203  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  41.9 
 
 		 876 aa  202  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  41.9 
 
 		 876 aa  202  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  40.7 
 
 		 883 aa  201  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  40.61 
 
 		 888 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  40.55 
 
 		 972 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  41.2 
 
 		 876 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  38.78 
 
 		 877 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  38.79 
 
 		 911 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  38.08 
 
 		 877 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  38.89 
 
 		 945 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  40 
 
 		 879 aa  195  7e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  40.15 
 
 		 888 aa  194  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  37.26 
 
 		 877 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  38.06 
 
 		 880 aa  194  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  38.1 
 
 		 899 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  37.64 
 
 		 877 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 891 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  39.1 
 
 		 912 aa  192  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 877 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 877 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  37.54 
 
 		 901 aa  193  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  40 
 
 		 936 aa  192  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 891 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 891 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 877 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 877 aa  192  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  40.62 
 
 		 965 aa  192  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  38.95 
 
 		 893 aa  191  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  40.53 
 
 		 892 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  37.74 
 
 		 877 aa  191  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  40.15 
 
 		 873 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  38.55 
 
 		 888 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  39.85 
 
 		 896 aa  190  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  38.16 
 
 		 936 aa  189  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  37.15 
 
 		 949 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  38.71 
 
 		 905 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  36.11 
 
 		 893 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11120  DNA polymerase I  35.69 
 
 		 937 aa  188  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  37.07 
 
 		 899 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  37.15 
 
 		 904 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  37.81 
 
 		 930 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  37.72 
 
 		 891 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  35.94 
 
 		 879 aa  186  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  35.76 
 
 		 910 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  36.55 
 
 		 901 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  37.37 
 
 		 908 aa  185  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  38.35 
 
 		 892 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  38.35 
 
 		 892 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0069  DNA polymerase I  38.14 
 
 		 953 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  38.33 
 
 		 924 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  36.61 
 
 		 909 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  38.7 
 
 		 892 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  35.79 
 
 		 875 aa  183  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  36.36 
 
 		 946 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  36.92 
 
 		 944 aa  182  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  37.16 
 
 		 843 aa  181  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  37.19 
 
 		 956 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  37.37 
 
 		 933 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  35.17 
 
 		 891 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  40 
 
 		 868 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  37.59 
 
 		 896 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  39.41 
 
 		 982 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 929 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  37.02 
 
 		 904 aa  178  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 920 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 920 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  39.02 
 
 		 878 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  37.24 
 
 		 902 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  35.09 
 
 		 945 aa  177  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  36.3 
 
 		 906 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  38.32 
 
 		 982 aa  177  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  37.85 
 
 		 893 aa  176  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  34.68 
 
 		 898 aa  175  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  36.26 
 
 		 484 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>