More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1793 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1793  trigger factor  100 
 
 		 431 aa  871    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  68.45 
 
 		 433 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  58.31 
 
 		 433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  55.68 
 
 		 435 aa  485  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  55.45 
 
 		 435 aa  475  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  48.01 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  46.96 
 
 		 440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  47.45 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  40.24 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  38.19 
 
 		 446 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  41.29 
 
 		 428 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  37.38 
 
 		 428 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  35.01 
 
 		 435 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  36.03 
 
 		 438 aa  259  6e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  35.61 
 
 		 435 aa  256  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  40.18 
 
 		 428 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  34.41 
 
 		 429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  39.57 
 
 		 428 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  38.77 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  37 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  39.04 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  39.04 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  39.04 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  39.04 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  39.04 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  39.04 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  39.04 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  39.04 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  34.41 
 
 		 429 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  34.41 
 
 		 429 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  39.04 
 
 		 425 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  32.86 
 
 		 442 aa  249  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  33.1 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  35.98 
 
 		 436 aa  248  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  36.6 
 
 		 433 aa  246  6.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  32.09 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  37.53 
 
 		 427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  32.8 
 
 		 435 aa  236  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  33.64 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  35.82 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  34.11 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  35.82 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  31.67 
 
 		 463 aa  234  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  34.49 
 
 		 432 aa  233  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  33.07 
 
 		 428 aa  232  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  32 
 
 		 435 aa  230  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  31.24 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  31.58 
 
 		 512 aa  226  6e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  31.34 
 
 		 433 aa  226  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  31.4 
 
 		 435 aa  226  8e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  30 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  36.19 
 
 		 451 aa  224  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  30.7 
 
 		 438 aa  224  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  33.09 
 
 		 446 aa  223  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  32.26 
 
 		 434 aa  223  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  32.26 
 
 		 434 aa  223  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  32.26 
 
 		 434 aa  223  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  36.43 
 
 		 438 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  31.41 
 
 		 435 aa  220  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  31.09 
 
 		 436 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  34.96 
 
 		 449 aa  218  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  34.61 
 
 		 427 aa  217  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  33.08 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  34.2 
 
 		 426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  32.21 
 
 		 471 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  31.8 
 
 		 434 aa  216  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  31.41 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  31.32 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  32.92 
 
 		 427 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  32.04 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  31.51 
 
 		 488 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  31.09 
 
 		 436 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  30.7 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  31.84 
 
 		 437 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  27.84 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  31.49 
 
 		 434 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  31.51 
 
 		 427 aa  211  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  30.23 
 
 		 434 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  28.2 
 
 		 436 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  30.3 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  30.3 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  30.3 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5225  trigger factor  29.77 
 
 		 448 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  30.7 
 
 		 436 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1348  trigger factor  29.55 
 
 		 448 aa  209  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514517  normal  0.0597463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  30.86 
 
 		 436 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  29.84 
 
 		 434 aa  209  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  30.47 
 
 		 434 aa  209  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  29.33 
 
 		 432 aa  209  8e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  30.41 
 
 		 434 aa  209  9e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  31.86 
 
 		 441 aa  209  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  30.07 
 
 		 434 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1466  trigger factor  29.93 
 
 		 449 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2324  trigger factor  29.93 
 
 		 449 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0174102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  30.07 
 
 		 434 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  28.77 
 
 		 438 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1233  trigger factor  29.93 
 
 		 449 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.026693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1958  trigger factor  29.93 
 
 		 449 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  30.07 
 
 		 434 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2366  trigger factor  29.93 
 
 		 449 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>