212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1253 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1253  hypothetical protein  100 
 
 		 679 aa  1379    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.337339  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3892  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.13 
 
 		 660 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2448  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.06 
 
 		 658 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2457  cytochrome d1 heme region  37.06 
 
 		 660 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2282  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.95 
 
 		 658 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.512242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1976  hypothetical protein  36.06 
 
 		 640 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2626  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.74 
 
 		 659 aa  256  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.77 
 
 		 752 aa  94.4  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.58 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.29 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  23.99 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.89 
 
 		 348 aa  82.8  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.09 
 
 		 689 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.5 
 
 		 354 aa  80.5  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  24.09 
 
 		 580 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  23.85 
 
 		 776 aa  79.7  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.39 
 
 		 354 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  27.72 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.85 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.56 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.2 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.7 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.8 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1252  putative signal peptide protein  32.3 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  0.989203 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1667 aa  74.3  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.77 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.12 
 
 		 317 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.5 
 
 		 348 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.52 
 
 		 324 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.34 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1080  cytochrome d1 heme region  31.68 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.952849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1172  cytochrome d1 heme region  31.68 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.912749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.32 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.32 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.88 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.32 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.32 
 
 		 377 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.71 
 
 		 328 aa  70.5  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.56 
 
 		 347 aa  70.1  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.84 
 
 		 345 aa  69.7  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.53 
 
 		 943 aa  69.7  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.21 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.42 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.17 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2064  putative signal peptide protein  32.62 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  29.07 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.36 
 
 		 272 aa  66.6  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.09 
 
 		 314 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.1 
 
 		 1170 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.87 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  26.8 
 
 		 819 aa  65.1  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.01 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1104  hypothetical protein  29.59 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1184  hypothetical protein  29.59 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.362079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.54 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  25.21 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.23 
 
 		 821 aa  63.9  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.61 
 
 		 154 aa  63.9  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6860  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.89 
 
 		 358 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.72 
 
 		 312 aa  62.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2474  hypothetical protein  24.07 
 
 		 364 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.686605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.33 
 
 		 316 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.58 
 
 		 318 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  26.01 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6812  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.85 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.444472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.67 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.36 
 
 		 417 aa  62  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.68 
 
 		 314 aa  62  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  20.48 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0690  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.77 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.408931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  20.89 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  25.64 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  20.4 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0482  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.81 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.87 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1437  hypothetical protein  28.32 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5463  hypothetical protein  29.19 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.55 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  25 
 
 		 332 aa  60.1  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1117  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.19 
 
 		 329 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.949748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.85 
 
 		 362 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.19 
 
 		 370 aa  60.1  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1802  hypothetical protein  27.91 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000263268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.01 
 
 		 327 aa  59.3  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.2 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  23.26 
 
 		 314 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2172  hypothetical protein  28.57 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5923  hypothetical protein  28.57 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2154  hypothetical protein  28.57 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.305615  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6515  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.52 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.761865  normal  0.0861969 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.32 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  29.65 
 
 		 810 aa  58.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2568  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1176 aa  58.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0813284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.85 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.85 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2513  hypothetical protein  26.51 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0188  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.9 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  30.34 
 
 		 1189 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2064  hypothetical protein  28.12 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>