143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2568 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2568  hypothetical protein  100 
 
 
1176 aa  2312    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0813284 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  22.62 
 
 
1667 aa  97.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.74 
 
 
383 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.67 
 
 
457 aa  79  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  23.05 
 
 
332 aa  77  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  31.13 
 
 
354 aa  75.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  26.67 
 
 
1094 aa  75.1  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  27.41 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  26.32 
 
 
819 aa  73.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  27.85 
 
 
329 aa  72.8  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.64 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.89 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.19 
 
 
362 aa  72  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.91 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.86 
 
 
521 aa  70.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.14 
 
 
362 aa  70.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  27.08 
 
 
580 aa  69.3  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.59 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.03 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.47 
 
 
522 aa  68.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.89 
 
 
354 aa  66.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.78 
 
 
320 aa  66.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  31.36 
 
 
971 aa  65.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.08 
 
 
689 aa  65.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1117  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.07 
 
 
331 aa  65.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  28.83 
 
 
387 aa  63.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  25.38 
 
 
487 aa  63.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.91 
 
 
338 aa  63.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.27 
 
 
334 aa  63.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.12 
 
 
607 aa  63.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1253  hypothetical protein  27.15 
 
 
679 aa  62.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.337339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.25 
 
 
366 aa  62.4  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.13 
 
 
321 aa  62  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  23 
 
 
325 aa  62  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.03 
 
 
406 aa  61.6  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  25.64 
 
 
479 aa  60.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2474  hypothetical protein  30.62 
 
 
364 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.686605  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  32.4 
 
 
480 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  24.19 
 
 
810 aa  60.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.55 
 
 
320 aa  60.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.37 
 
 
320 aa  60.1  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  24.92 
 
 
312 aa  60.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.97 
 
 
329 aa  58.9  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  28.53 
 
 
1189 aa  58.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.55 
 
 
328 aa  58.5  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 
776 aa  58.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.73 
 
 
1170 aa  58.2  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01887  putative hemagglutinin-related protein  36.2 
 
 
446 aa  57.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  26.47 
 
 
391 aa  57.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.98 
 
 
334 aa  58.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  23.97 
 
 
329 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.14 
 
 
305 aa  57.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.25 
 
 
328 aa  57.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  30.04 
 
 
314 aa  57  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.84 
 
 
328 aa  57  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.86 
 
 
317 aa  56.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.46 
 
 
415 aa  56.6  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.29 
 
 
327 aa  56.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.52 
 
 
353 aa  55.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.16 
 
 
323 aa  56.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.57 
 
 
652 aa  55.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  27.31 
 
 
408 aa  55.5  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.96 
 
 
329 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.06 
 
 
329 aa  55.1  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.98 
 
 
313 aa  54.3  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.26 
 
 
312 aa  54.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3971  hypothetical protein  28.42 
 
 
377 aa  54.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25 
 
 
332 aa  54.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.66 
 
 
348 aa  53.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.07 
 
 
348 aa  53.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.27 
 
 
752 aa  53.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  23.2 
 
 
335 aa  53.5  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  23.11 
 
 
827 aa  53.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.15 
 
 
336 aa  53.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.57 
 
 
318 aa  53.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6515  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.95 
 
 
385 aa  53.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.761865  normal  0.0861969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.91 
 
 
324 aa  52.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.96 
 
 
272 aa  52  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.03 
 
 
974 aa  52.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6812  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.34 
 
 
363 aa  52.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.444472  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0790  hypothetical protein  27.44 
 
 
385 aa  52.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0240573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1165  hypothetical protein  29.41 
 
 
325 aa  52  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1767  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.59 
 
 
433 aa  52  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.56 
 
 
1056 aa  51.6  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.19 
 
 
335 aa  51.6  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.55 
 
 
821 aa  51.6  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0482  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.79 
 
 
326 aa  51.6  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1976  hypothetical protein  31.48 
 
 
640 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.24 
 
 
326 aa  51.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  29.76 
 
 
556 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6221  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.16 
 
 
810 aa  50.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.06 
 
 
345 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6217  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.6 
 
 
829 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597655  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  31.29 
 
 
414 aa  50.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.39 
 
 
889 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.78 
 
 
314 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.83 
 
 
328 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  28.72 
 
 
353 aa  49.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  22.41 
 
 
376 aa  49.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.31 
 
 
451 aa  48.9  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>