More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4073 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 208 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  63.94 
 
 		 213 aa  275  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  47.37 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  50.98 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  46.6 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3275  Methyltransferase type 11  45.71 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00288656  normal  0.645972 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  48.5 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.5 
 
 		 503 aa  180  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1551  Methyltransferase type 11  39.61 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.669083  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0883  methyltransferase type 11  45.24 
 
 		 191 aa  154  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00365145  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2928  SAM-dependent methyltransferase  39.71 
 
 		 218 aa  152  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000530736  hitchhiker  0.00484041 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1193  Methyltransferase type 11  41.87 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0170367  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0544  Methyltransferase type 11  41.06 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0016502  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0954  Methyltransferase type 11  38.12 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 229 aa  131  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12035  hypothetical protein  37.38 
 
 		 285 aa  121  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0256  methlytransferase  34.52 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.272291  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1780  methyltransferase type 11  40.94 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115692  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0409  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0871  methyltransferase type 11  39.26 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1031  methyltransferase type 11  37.64 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.26 
 
 		 265 aa  87.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1393  methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1860  methyltransferase type 11  36.31 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.762875 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0910  methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.98 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28.4 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  36.77 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1314  methyltransferase type 11  37.13 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.490863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  29.72 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  34.42 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 340 aa  62.4  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  32.75 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5905  Methyltransferase type 11  39.66 
 
 		 245 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  31.95 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1427  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00176149  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.4 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1295  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.17 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3308  demethylmenaquinone methyltransferase  33.58 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.15 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 317 aa  58.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  34.07 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  28.43 
 
 		 310 aa  58.2  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0064  Methyltransferase type 11  25.36 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.25 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  28.34 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  32 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25.12 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  27.07 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  26.46 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.39 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  28.25 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  29.12 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 2490 aa  55.1  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2368  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000109502  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.77 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  29.79 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.38 
 
 		 325 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  33.88 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2621  Methyltransferase type 11  39.18 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0846  Methyltransferase type 11  46.38 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 263 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  28.05 
 
 		 312 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4481  methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980043  normal  0.396448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>