46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2112 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3100  2-nitropropane dioxygenase, NPD  66.16 
 
 		 554 aa  689    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2112  PfaD family protein  100 
 
 		 554 aa  1132    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  68.11 
 
 		 554 aa  747    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2106  PfaD family protein  96.93 
 
 		 554 aa  1075    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2266  PfaD family protein  69.21 
 
 		 477 aa  660    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1675  PfaD family protein  52.17 
 
 		 557 aa  544  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.752172  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0463  PfaD family protein  55.51 
 
 		 542 aa  539  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1420  PfaD family protein  56.71 
 
 		 545 aa  536  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2910  PfaD family protein  56.65 
 
 		 542 aa  536  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3205  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.49 
 
 		 541 aa  533  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1218  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.36 
 
 		 542 aa  525  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2668  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.68 
 
 		 545 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2630  hypothetical protein  51.06 
 
 		 542 aa  513  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1422  PfaD family protein  50.98 
 
 		 548 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1450  PfaD family protein  50.68 
 
 		 548 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1112  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  54.64 
 
 		 537 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1416  PfaD family protein  50.68 
 
 		 548 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1323  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.19 
 
 		 552 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.596001  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2932  PfaD family protein  50.49 
 
 		 548 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.266003  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1597  hypothetical protein  48.26 
 
 		 547 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.57 
 
 		 550 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2669  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.57 
 
 		 550 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3099  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  47.97 
 
 		 532 aa  502  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2843  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.64 
 
 		 548 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1687  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  47.9 
 
 		 531 aa  499  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4451  PfaD family protein  45.44 
 
 		 549 aa  482  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.898677  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2594  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.3 
 
 		 552 aa  481  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4751  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.43 
 
 		 525 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4239  PfaD family protein  52.56 
 
 		 539 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3913  PfaD family protein  45.53 
 
 		 556 aa  455  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5626  hypothetical protein  48.13 
 
 		 526 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0687  peptidase M22, glycoprotease  45.53 
 
 		 530 aa  443  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000276719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2929  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.42 
 
 		 553 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3952  PfaD family protein  49 
 
 		 550 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0190583  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3105  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  42.48 
 
 		 764 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1432  PfaD family protein  41.38 
 
 		 481 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0854  PfaD family protein  40.65 
 
 		 803 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2587  PfaD family protein  43.45 
 
 		 865 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1675  MmpIII  42.92 
 
 		 1154 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5305  PfaD family protein  36.9 
 
 		 790 aa  297  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.108741 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  24 
 
 		 323 aa  46.2  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4936  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.9 
 
 		 492 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.121654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.74 
 
 		 323 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  36.13 
 
 		 324 aa  45.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  35.06 
 
 		 368 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.72 
 
 		 327 aa  44.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>