More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7095 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7095  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
252 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.98 
 
 
247 aa  298  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.98 
 
 
247 aa  298  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.04 
 
 
268 aa  298  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.98 
 
 
248 aa  296  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.8 
 
 
256 aa  292  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.25 
 
 
260 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11168  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.5 
 
 
247 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.5 
 
 
247 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  normal  0.265032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.1 
 
 
247 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.55 
 
 
249 aa  277  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.74 
 
 
188 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.32 
 
 
248 aa  275  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.94 
 
 
234 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.283479  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.24 
 
 
282 aa  271  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.22 
 
 
254 aa  258  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
251 aa  221  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
233 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 
233 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 
233 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
234 aa  204  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
233 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.97 
 
 
247 aa  201  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 
247 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
256 aa  178  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000512545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0721  2-hydroxycyclohexanecarboxyl-CoA dehydrogenase  43.15 
 
 
255 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
255 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
260 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
253 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
255 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3832  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
260 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.919217  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
260 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.136099 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.23 
 
 
246 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
254 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0694225  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1185  2-hydroxycyclohexanecarboxyl-CoA dehydrogenase  43.42 
 
 
255 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.938573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.23 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3549  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  39.34 
 
 
248 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  39.84 
 
 
247 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
253 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.145372 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  40.24 
 
 
264 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  40.24 
 
 
264 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
258 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.25 
 
 
246 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
264 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1850  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  37.01 
 
 
255 aa  159  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00172962  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04660  2-hydroxycyclohexane-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  43.57 
 
 
261 aa  158  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.14 
 
 
246 aa  158  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
257 aa  158  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  40.24 
 
 
247 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02008  oxidoreductase protein  44.88 
 
 
257 aa  158  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  38.43 
 
 
246 aa  158  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.24 
 
 
247 aa  158  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000457862  decreased coverage  0.00144514 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  38.84 
 
 
246 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  39.84 
 
 
247 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.23 
 
 
255 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
266 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
254 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  37.45 
 
 
246 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.67 
 
 
247 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
251 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0435  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.34 
 
 
238 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
275 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
263 aa  156  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
249 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 
240 aa  156  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 
247 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  39.36 
 
 
248 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  39.36 
 
 
248 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.96 
 
 
245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02878  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.25 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 
246 aa  155  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
248 aa  155  7e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  37.05 
 
 
260 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  37.35 
 
 
246 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
255 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3935  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.46 
 
 
249 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  37.35 
 
 
248 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  37.35 
 
 
246 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  37.35 
 
 
246 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  37.35 
 
 
246 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
265 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.1 
 
 
245 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  37.35 
 
 
246 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  37.35 
 
 
246 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  39.02 
 
 
247 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.43 
 
 
247 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
245 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1608  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39 
 
 
244 aa  153  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000263068  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.48 
 
 
246 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
257 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1936  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.33 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000245701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00853251  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  37.35 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>