More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5926 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5926  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 619 aa  1241    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740175  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0692  aspartyl-tRNA synthetase  82.94 
 
 		 620 aa  972    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0534  aspartyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 588 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 592 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 593 aa  565  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 593 aa  566  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 590 aa  560  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 585 aa  555  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 596 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 586 aa  553  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 594 aa  549  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 593 aa  551  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 594 aa  548  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 627 aa  546  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 598 aa  547  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 602 aa  543  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 594 aa  544  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 603 aa  543  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 600 aa  544  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 595 aa  543  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 600 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 594 aa  540  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 589 aa  537  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 593 aa  537  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 592 aa  538  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 588 aa  538  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 594 aa  538  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 604 aa  536  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 594 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 594 aa  533  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 586 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 607 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 		 599 aa  529  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 608 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 594 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 590 aa  528  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 589 aa  530  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 		 600 aa  530  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 592 aa  527  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 598 aa  527  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 591 aa  526  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 597 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 597 aa  527  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 578 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 609 aa  524  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 597 aa  523  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04440  aspartyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 592 aa  522  1e-147  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.462018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 597 aa  523  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 597 aa  520  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 590 aa  519  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 617 aa  519  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 584 aa  521  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 601 aa  519  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 613 aa  518  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 579 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 602 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 589 aa  516  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 584 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 596 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 607 aa  518  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0600  aspartyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 592 aa  516  1.0000000000000001e-145  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 614 aa  515  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 623 aa  515  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 585 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 599 aa  512  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 605 aa  512  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 600 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1326  aspartyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 604 aa  514  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 601 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 599 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 623 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1621  aspartyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 599 aa  514  1e-144  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.504505  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2475  aspartyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 595 aa  514  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 592 aa  513  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 610 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 592 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 591 aa  509  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 591 aa  510  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 		 599 aa  511  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 589 aa  510  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 591 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 591 aa  509  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 600 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 600 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1333  aspartyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 579 aa  509  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0605177  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 582 aa  509  1e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 594 aa  509  1e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 591 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 591 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 600 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 602 aa  511  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 591 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 591 aa  510  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 600 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 600 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 600 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 600 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 600 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 605 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 600 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>