More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5491 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5491  putative cytochrome P450  100 
 
 
488 aa  948    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767325  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1142  putative cytochrome P450  53.03 
 
 
421 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15529  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2803  putative cytochrome P450-family protein  50.25 
 
 
414 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348302  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4812  cytochrome P450-family protein  46.87 
 
 
446 aa  355  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2751  putative cytochrome P450-family protein  50 
 
 
426 aa  349  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.581871  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5490  putative cytochrome P450  48.3 
 
 
437 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0347822  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4334  putative cytochrome P450  41.63 
 
 
484 aa  294  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4583  putative cytochrome P450  38.77 
 
 
471 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33530  cytochrome P450  35.96 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.101916  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2975  putative cytochrome P450  36.98 
 
 
452 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1747  putative cytochrome P450  35.59 
 
 
454 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0264528  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1433  Cytochrome P450-like protein  36.04 
 
 
424 aa  189  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.667112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2597  Cytochrome P450  37.6 
 
 
500 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  0.048774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4184  cytochrome P450 monooxygenase  35.92 
 
 
406 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1685  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4420  putative cytochrome P450  36.87 
 
 
440 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4556  putative cytochrome P450  34.99 
 
 
442 aa  177  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3959  Cytochrome P450-like protein  35.19 
 
 
465 aa  141  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  33.12 
 
 
426 aa  139  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  29.2 
 
 
405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  33.85 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  28.61 
 
 
412 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  32.58 
 
 
412 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  26.9 
 
 
420 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  29.05 
 
 
421 aa  123  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  30.05 
 
 
419 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  28.91 
 
 
410 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  27.3 
 
 
409 aa  120  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  27.98 
 
 
424 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  31.33 
 
 
411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4427  cytochrome P450  32.38 
 
 
382 aa  117  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  27.43 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  26.74 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  29.03 
 
 
412 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  30.05 
 
 
430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  33.75 
 
 
436 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  28.68 
 
 
400 aa  113  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  28.86 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  28.33 
 
 
409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  26.1 
 
 
411 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  26.1 
 
 
411 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  25.79 
 
 
411 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  30.59 
 
 
436 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  31.86 
 
 
400 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  27.04 
 
 
411 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  30.5 
 
 
417 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  28.31 
 
 
400 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  26.73 
 
 
411 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  32.28 
 
 
402 aa  110  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  25.47 
 
 
411 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  25.47 
 
 
411 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  27.04 
 
 
411 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  30.21 
 
 
398 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  28.71 
 
 
408 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  30.66 
 
 
402 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  29.21 
 
 
391 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  30.88 
 
 
423 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  32.89 
 
 
430 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  33.25 
 
 
406 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3533  cytochrome P450  29.64 
 
 
432 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173576  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  30.06 
 
 
367 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4902  cytochrome P450  30.91 
 
 
376 aa  107  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  25.76 
 
 
411 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  32.26 
 
 
403 aa  106  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  27.89 
 
 
396 aa  106  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  28.32 
 
 
422 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  29.32 
 
 
402 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  31.2 
 
 
399 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  25.42 
 
 
411 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  31.05 
 
 
400 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  29.7 
 
 
424 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  28.12 
 
 
421 aa  105  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  29.48 
 
 
407 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  29.48 
 
 
407 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  27.25 
 
 
416 aa  104  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  29.48 
 
 
407 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  30.87 
 
 
400 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  29.27 
 
 
406 aa  103  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  33.46 
 
 
393 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3059  cytochrome P450  29.53 
 
 
417 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  32.93 
 
 
443 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  28.01 
 
 
399 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  30.42 
 
 
415 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  31.4 
 
 
394 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  29.23 
 
 
399 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  27.79 
 
 
405 aa  100  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  30.32 
 
 
407 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  27.61 
 
 
387 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  27.55 
 
 
418 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  27.78 
 
 
407 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  30.72 
 
 
366 aa  99.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  31.07 
 
 
398 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  27.46 
 
 
408 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  27.15 
 
 
408 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  29.13 
 
 
410 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  31.16 
 
 
395 aa  98.2  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  32.4 
 
 
439 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  28.2 
 
 
401 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  29.06 
 
 
402 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  29.02 
 
 
400 aa  97.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  28.8 
 
 
398 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>