More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4529 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4529  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 529 aa  1048    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3230  AMP-dependent synthetase and ligase  52.16 
 
 		 526 aa  522  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4020  AMP-dependent synthetase and ligase  43.62 
 
 		 523 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.165206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  43.24 
 
 		 523 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0173498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3946  AMP-dependent synthetase and ligase  43.62 
 
 		 523 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0707  putative AMP-dependent synthetase and ligase  40.68 
 
 		 536 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.706357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3492  AMP-dependent synthetase and ligase  38.22 
 
 		 555 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  37.27 
 
 		 553 aa  240  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 		 551 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2153  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 591 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  32.25 
 
 		 601 aa  236  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 587 aa  229  9e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 		 584 aa  223  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1650  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 		 571 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67945  normal  0.887385 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 		 582 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01100  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  33.4 
 
 		 644 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1823  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 		 590 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  36.15 
 
 		 578 aa  214  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 574 aa  210  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 		 583 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0681  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 		 570 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.577585  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  31.96 
 
 		 548 aa  206  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.01 
 
 		 483 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.01 
 
 		 483 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 		 511 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 516 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 		 519 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0489  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 569 aa  201  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 		 570 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.54 
 
 		 483 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3536  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 530 aa  200  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3146  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 533 aa  199  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.683024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  31.38 
 
 		 549 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 515 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  29.37 
 
 		 576 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 511 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 		 520 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 		 525 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.8 
 
 		 477 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 502 aa  195  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.17 
 
 		 514 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 518 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.72 
 
 		 478 aa  194  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 		 566 aa  194  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.6 
 
 		 512 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 507 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 		 662 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0355  putative AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 559 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476101  hitchhiker  0.000011609 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 508 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  29.65 
 
 		 560 aa  190  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 504 aa  190  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  30.13 
 
 		 543 aa  189  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 		 520 aa  189  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 		 500 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2124  AMP-dependent synthetase and ligase  28.73 
 
 		 565 aa  187  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.58 
 
 		 490 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 		 510 aa  187  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 521 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0237  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 		 602 aa  187  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 542 aa  186  6e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.14 
 
 		 516 aa  187  6e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  28.69 
 
 		 518 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 518 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  27.89 
 
 		 584 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 525 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0315  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 510 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.24 
 
 		 561 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  28.87 
 
 		 587 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.77 
 
 		 561 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  29.8 
 
 		 544 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.21 
 
 		 582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  28.83 
 
 		 552 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.27 
 
 		 561 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.2 
 
 		 579 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 518 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  31.47 
 
 		 520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  32.12 
 
 		 549 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 		 843 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 563 aa  184  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  28.81 
 
 		 550 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 		 502 aa  183  6e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.9 
 
 		 582 aa  183  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 509 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.32 
 
 		 570 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 541 aa  182  9.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.49 
 
 		 579 aa  183  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.51 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.27 
 
 		 563 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  31.3 
 
 		 508 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.08 
 
 		 561 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.27 
 
 		 563 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.01 
 
 		 561 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  31.62 
 
 		 548 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  28.52 
 
 		 552 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  30.04 
 
 		 557 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  29.44 
 
 		 576 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 518 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  31.04 
 
 		 506 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>