More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2272 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  100 
 
 		 385 aa  731    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  51.47 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  49.09 
 
 		 354 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2547  ABC transporter related  48.67 
 
 		 354 aa  288  9e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  48.02 
 
 		 384 aa  278  9e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  48.26 
 
 		 344 aa  272  9e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  48.53 
 
 		 347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.79 
 
 		 343 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  47.86 
 
 		 349 aa  256  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  46.17 
 
 		 352 aa  250  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  60.27 
 
 		 247 aa  238  9e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2810  ABC transporter related protein  43.55 
 
 		 367 aa  226  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4968  ABC transporter related protein  48.25 
 
 		 350 aa  225  8e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  42.42 
 
 		 372 aa  209  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  46.99 
 
 		 363 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.87 
 
 		 359 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  42.63 
 
 		 363 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  44.91 
 
 		 352 aa  199  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  46.61 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2904  ABC transporter related  43.77 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000149556  hitchhiker  0.0000207789 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  38.86 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2238  ABC transporter related protein  35.82 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.32 
 
 		 366 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2304  ABC transporter related protein  50.57 
 
 		 335 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  41.19 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1606  ABC transporter related  43.22 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  43.5 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  41.07 
 
 		 362 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0297  ABC transporter related  46.29 
 
 		 359 aa  193  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.292775  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1067  ABC transporter related  43.58 
 
 		 346 aa  193  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67887  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  37.87 
 
 		 351 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.22 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.5 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.22 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.22 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  36.78 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.44 
 
 		 377 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  36.61 
 
 		 372 aa  189  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18140  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  41.74 
 
 		 347 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0277574  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0983  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.22 
 
 		 377 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  42.91 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  40.31 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  42.9 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  37.73 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.46 
 
 		 367 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  45.29 
 
 		 342 aa  187  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1782  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.47 
 
 		 364 aa  186  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.51 
 
 		 377 aa  186  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  48.26 
 
 		 360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  41.96 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.93 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2476  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.54 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.615862  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.54 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.54 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0183  ABC transporter related  45.66 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.14 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.32 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  48.44 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  40.47 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  36.54 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.54 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  42.56 
 
 		 357 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  41.42 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  36.54 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.54 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.54 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  36.99 
 
 		 364 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  34.05 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.38 
 
 		 357 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  44.92 
 
 		 372 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08431  ABC transporter ATP-binding protein  42.53 
 
 		 352 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519421 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.95 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  44.92 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.69 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00164  putative ABC-type transport system, ATPase component  39.21 
 
 		 344 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  39.26 
 
 		 350 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.09 
 
 		 367 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  43.4 
 
 		 370 aa  182  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0211  ATPase  42.08 
 
 		 352 aa  183  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3481  ABC transporter related  41.51 
 
 		 361 aa  182  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.6 
 
 		 352 aa  182  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0927  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.54 
 
 		 377 aa  182  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1821  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 347 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.377882  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1785  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 347 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2083  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 347 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0353  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 347 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5373  ABC transporter related  41.99 
 
 		 347 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1110  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 347 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5487  ABC transporter related  41.99 
 
 		 347 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.523314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  34.32 
 
 		 400 aa  182  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0819  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 347 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  46.85 
 
 		 390 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  44.12 
 
 		 347 aa  182  8.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  44.77 
 
 		 387 aa  182  8.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3746  ABC transporter related  41.71 
 
 		 358 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  46.18 
 
 		 387 aa  182  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2777  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.27 
 
 		 332 aa  182  9.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>