More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2452 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2452  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 441 aa  894    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3266  putative transcriptional regulator, GntR family  50.93 
 
 		 426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4591  putative transcriptional regulator, GntR family  52.46 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374822  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2660  GntR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220468  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2477  aminotransferase, class I and II  49.88 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.055447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1742  putative transcriptional regulator, GntR family  43.59 
 
 		 430 aa  352  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3064  putative transcriptional regulator, GntR family  38.8 
 
 		 449 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  35.67 
 
 		 439 aa  186  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  34.49 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  34.22 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 446 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  31.11 
 
 		 611 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 441 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  32.68 
 
 		 436 aa  167  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  33.9 
 
 		 437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 401 aa  163  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 441 aa  161  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 454 aa  161  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 399 aa  160  5e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  30.12 
 
 		 438 aa  160  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  28.39 
 
 		 425 aa  159  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 435 aa  159  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  35.79 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  29.1 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  30.87 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  29.04 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 403 aa  157  5.0000000000000005e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 399 aa  156  7e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  28.5 
 
 		 397 aa  150  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  30.11 
 
 		 401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  31.81 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  31.44 
 
 		 437 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 402 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  26.65 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  31.67 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  31.42 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  31.67 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 416 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 402 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  31.17 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  31.58 
 
 		 394 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  31.64 
 
 		 463 aa  142  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4485  aminotransferase, class I and II  31.03 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0118141 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  30.4 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  28 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  30.27 
 
 		 396 aa  140  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0003  putative transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 378 aa  139  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.761486  hitchhiker  0.000119798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  29.13 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  29.07 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 395 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  30.58 
 
 		 393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1052  putative transcriptional regulator, GntR family  31.52 
 
 		 398 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  26.68 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  30.38 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  30.38 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  29.85 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.35 
 
 		 517 aa  133  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 397 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  31.08 
 
 		 393 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  31.06 
 
 		 416 aa  132  7.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  30.1 
 
 		 417 aa  133  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  31.22 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  31.22 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  33.58 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  29 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4999  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160838 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  31.22 
 
 		 408 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  30.07 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  29.32 
 
 		 401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  28.08 
 
 		 398 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  29.98 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>