More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1618 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  94.97 
 
 		 199 aa  377  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  74.05 
 
 		 204 aa  280  9e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  65.84 
 
 		 205 aa  269  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  66.33 
 
 		 210 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  69.52 
 
 		 207 aa  268  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  70.9 
 
 		 214 aa  267  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  68.82 
 
 		 200 aa  266  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  67.18 
 
 		 210 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  67.18 
 
 		 210 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  67.18 
 
 		 210 aa  265  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  70.27 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  68.42 
 
 		 206 aa  265  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  69.73 
 
 		 213 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  68.95 
 
 		 206 aa  264  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  67.89 
 
 		 194 aa  263  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  65.97 
 
 		 212 aa  263  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  65.45 
 
 		 220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  64.4 
 
 		 200 aa  252  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  66.32 
 
 		 199 aa  251  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  64.02 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  66.48 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  62.5 
 
 		 201 aa  248  5e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  65.05 
 
 		 197 aa  247  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  68.33 
 
 		 247 aa  247  8e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  62.5 
 
 		 201 aa  246  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  61.9 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  65.57 
 
 		 220 aa  245  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  63.93 
 
 		 227 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  63.93 
 
 		 205 aa  239  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  62.3 
 
 		 226 aa  239  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3018  response regulator receiver  68.06 
 
 		 207 aa  238  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11030  response regulator with putative antiterminator output domain  60.73 
 
 		 198 aa  228  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.241703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  57.53 
 
 		 206 aa  228  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  59.68 
 
 		 215 aa  228  6e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  52.75 
 
 		 197 aa  216  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.69 
 
 		 194 aa  211  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  54.95 
 
 		 195 aa  208  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.69 
 
 		 194 aa  207  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  51.65 
 
 		 191 aa  206  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  53.85 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0739  putative response regulator  47 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000540248  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  50.76 
 
 		 203 aa  190  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0616  response regulator receiver domain protein  44.5 
 
 		 249 aa  180  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.26 
 
 		 196 aa  174  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  45.99 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.68 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  47.89 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.92 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.62 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2517  response regulator receiver and ANTAR domain protein  46.15 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.96 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.25 
 
 		 220 aa  157  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.6 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.31 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  38.17 
 
 		 191 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.96 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2091  response regulator  43.72 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.68 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0084  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.97 
 
 		 242 aa  142  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3764  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.7 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0425638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2394  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.33 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108275  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2028  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.91 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000049817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.36 
 
 		 208 aa  137  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0678  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.21 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5028  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.49 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181706  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.14 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1293  response regulator receiver protein  42.55 
 
 		 159 aa  121  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.07 
 
 		 190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  42.76 
 
 		 636 aa  111  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2031  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.16 
 
 		 198 aa  111  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000027462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2811  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.51 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2864  Fis family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561884  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 122 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 		 355 aa  105  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0963  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.68 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000231614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  33.33 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 377 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  44.25 
 
 		 117 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  33.51 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.2 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  42.02 
 
 		 352 aa  99.4  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 123 aa  99.4  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 359 aa  98.6  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 122 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.83 
 
 		 455 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  41.38 
 
 		 380 aa  96.7  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.94 
 
 		 196 aa  95.9  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 120 aa  95.9  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  38.98 
 
 		 461 aa  95.1  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  40 
 
 		 667 aa  95.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 316 aa  95.1  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  44.76 
 
 		 122 aa  95.1  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.46 
 
 		 701 aa  94.7  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.79 
 
 		 195 aa  94.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.57 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 120 aa  94.7  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40 
 
 		 455 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  43.22 
 
 		 429 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 		 120 aa  93.6  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>