111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0403 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0403  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  288  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3639  hypothetical protein  48.92 
 
 		 169 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563989  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  49.32 
 
 		 273 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  51.8 
 
 		 280 aa  131  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  44.9 
 
 		 277 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  47.37 
 
 		 288 aa  128  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  43.17 
 
 		 279 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  43.54 
 
 		 279 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  48.23 
 
 		 215 aa  124  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  48.34 
 
 		 290 aa  125  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  46.76 
 
 		 302 aa  123  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  45.27 
 
 		 268 aa  123  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  43.06 
 
 		 280 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  41.61 
 
 		 268 aa  120  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0574  hypothetical protein  48.2 
 
 		 214 aa  120  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  46.76 
 
 		 279 aa  117  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  48.92 
 
 		 279 aa  114  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  39.72 
 
 		 288 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4030  hypothetical protein  43.88 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  45.65 
 
 		 268 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  49.21 
 
 		 252 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  62.64 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1516  hypothetical protein  42.38 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  40.43 
 
 		 266 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  42.86 
 
 		 306 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  41.55 
 
 		 268 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  35.25 
 
 		 265 aa  104  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  42.18 
 
 		 268 aa  104  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  43.48 
 
 		 267 aa  103  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  40.8 
 
 		 266 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  40.14 
 
 		 272 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  38.93 
 
 		 283 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  36.76 
 
 		 277 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  38.51 
 
 		 277 aa  100  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  40.27 
 
 		 266 aa  99.8  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1745  hypothetical protein  43.57 
 
 		 218 aa  99  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0889269  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  46.67 
 
 		 269 aa  98.6  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  43.84 
 
 		 263 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  41.67 
 
 		 268 aa  98.6  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  37.76 
 
 		 269 aa  98.2  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  41.73 
 
 		 270 aa  98.6  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  40.85 
 
 		 271 aa  98.2  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  41.67 
 
 		 276 aa  97.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  40.29 
 
 		 323 aa  97.1  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  38.16 
 
 		 270 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  39.04 
 
 		 277 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  40.58 
 
 		 262 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  38.3 
 
 		 267 aa  95.9  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  39.74 
 
 		 277 aa  95.9  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  39.29 
 
 		 293 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  38.41 
 
 		 271 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  36 
 
 		 275 aa  94.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  44.93 
 
 		 271 aa  94.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  41.13 
 
 		 267 aa  93.6  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  37.23 
 
 		 284 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  36.73 
 
 		 270 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  39.26 
 
 		 281 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  42.25 
 
 		 268 aa  92.8  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  38.89 
 
 		 333 aa  92.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  42.14 
 
 		 266 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  40.71 
 
 		 266 aa  92  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  39.42 
 
 		 264 aa  90.5  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  41.5 
 
 		 298 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  39.04 
 
 		 267 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  36.96 
 
 		 272 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  36.36 
 
 		 272 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  38.85 
 
 		 262 aa  88.2  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  39.31 
 
 		 274 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  39.29 
 
 		 266 aa  88.6  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  34.53 
 
 		 278 aa  87.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  36.17 
 
 		 265 aa  87  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  36.73 
 
 		 283 aa  85.9  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  33.09 
 
 		 274 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3109  hypothetical protein  44.23 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  33.8 
 
 		 269 aa  84.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  33.1 
 
 		 272 aa  84.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  40.43 
 
 		 271 aa  84.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  35 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  38.97 
 
 		 263 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  34.72 
 
 		 267 aa  81.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  37.06 
 
 		 271 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3527  hypothetical protein  56.76 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672122  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  34.53 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  33.57 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  37.32 
 
 		 271 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1307  protein of unknown function DUF574  37.9 
 
 		 274 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0163333  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08330  Protein of unknown function (DUF574)  34.56 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  36.69 
 
 		 276 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  31.76 
 
 		 273 aa  74.7  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3589  protein of unknown function DUF574  36.64 
 
 		 277 aa  73.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.801624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  37.61 
 
 		 234 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  33.57 
 
 		 275 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20220  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  34.03 
 
 		 277 aa  71.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00509085  normal  0.22266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  33.97 
 
 		 286 aa  70.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  33.11 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  30.82 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  28.57 
 
 		 283 aa  67.8  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0565  protein of unknown function DUF574  30.19 
 
 		 277 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  29.79 
 
 		 269 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  35.25 
 
 		 266 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>