121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3589 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3589  protein of unknown function DUF574  100 
 
 
277 aa  562  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.801624  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  38.58 
 
 
269 aa  159  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  38.93 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  40.59 
 
 
268 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  37.15 
 
 
288 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  37.55 
 
 
286 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  35.29 
 
 
270 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  39.2 
 
 
323 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  38.17 
 
 
273 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  36.8 
 
 
274 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  38.8 
 
 
272 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  37.34 
 
 
266 aa  142  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  34.92 
 
 
272 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  37.71 
 
 
266 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  35 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  36.33 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  35.46 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  37.34 
 
 
266 aa  139  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  33.62 
 
 
283 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  36.44 
 
 
263 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  35.62 
 
 
266 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0528  protein of unknown function DUF574  35.44 
 
 
266 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253629  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  32.43 
 
 
279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  36.29 
 
 
273 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  34.45 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  35.09 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  38.75 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  36.76 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  34.62 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  36.02 
 
 
271 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  35.02 
 
 
267 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  35.34 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  37.34 
 
 
328 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  36.51 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08330  Protein of unknown function (DUF574)  33.58 
 
 
272 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  33.59 
 
 
280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  32.73 
 
 
277 aa  128  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  33.2 
 
 
267 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  33.33 
 
 
268 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  35.59 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  34.75 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  34.45 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  36.82 
 
 
283 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  35.11 
 
 
268 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  34.29 
 
 
281 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  33.98 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  33.47 
 
 
280 aa  125  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  38.07 
 
 
252 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  32.08 
 
 
290 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  33.33 
 
 
283 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  31.78 
 
 
283 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  35.29 
 
 
271 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  37.65 
 
 
264 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  35.71 
 
 
306 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  33.9 
 
 
277 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  33.47 
 
 
253 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  34.87 
 
 
276 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1307  protein of unknown function DUF574  34.03 
 
 
274 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0163333  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  36.55 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  32.42 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  33.58 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  33.98 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  36.05 
 
 
268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  33.2 
 
 
268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  34.51 
 
 
272 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  34.69 
 
 
269 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  34.73 
 
 
285 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  32.65 
 
 
269 aa  118  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  33.74 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  32.92 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  33.2 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  35.54 
 
 
298 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  35.56 
 
 
267 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  33.19 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  32.37 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  35.66 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  33.47 
 
 
284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  30.64 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  32.65 
 
 
277 aa  113  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  32.55 
 
 
271 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  36.94 
 
 
215 aa  112  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  31.49 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  30.77 
 
 
275 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  39.44 
 
 
182 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  32.03 
 
 
263 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  31.95 
 
 
293 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  32.34 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  35.17 
 
 
234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  35.29 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20220  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  32.64 
 
 
277 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00509085  normal  0.22266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  31.75 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  29.34 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  31.01 
 
 
278 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0565  protein of unknown function DUF574  31.43 
 
 
277 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  32.23 
 
 
269 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  32.54 
 
 
274 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  31.98 
 
 
270 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11550  Protein of unknown function (DUF574)  30.27 
 
 
276 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356734  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0067  hypothetical protein  28.45 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303807  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38460  Protein of unknown function (DUF574)  29.46 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>