122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0565 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0565  protein of unknown function DUF574  100 
 
 
277 aa  571  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38460  Protein of unknown function (DUF574)  58.2 
 
 
282 aa  301  7.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  48.54 
 
 
278 aa  265  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  49.06 
 
 
267 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  46.72 
 
 
284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  42.34 
 
 
272 aa  205  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  41.91 
 
 
273 aa  199  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  43.4 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  43.27 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  42.57 
 
 
288 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  43.7 
 
 
270 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  44.92 
 
 
262 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  42.41 
 
 
279 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  42.8 
 
 
266 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  43.85 
 
 
266 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  42.75 
 
 
276 aa  188  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  41.39 
 
 
283 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  42.8 
 
 
266 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  41.63 
 
 
286 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  40.81 
 
 
280 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  42.8 
 
 
266 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  40.54 
 
 
272 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  40.07 
 
 
280 aa  185  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  41.49 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  44.44 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  41.76 
 
 
288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  43.43 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  41.97 
 
 
268 aa  183  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  42.92 
 
 
290 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  43.85 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  40.89 
 
 
274 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  42.74 
 
 
271 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  39.33 
 
 
274 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  44.54 
 
 
277 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  42.91 
 
 
284 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  42.15 
 
 
266 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  40.31 
 
 
262 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  42.28 
 
 
266 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  40.08 
 
 
267 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  39.93 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  40 
 
 
333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  39.68 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  41.44 
 
 
285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  40.45 
 
 
275 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  42 
 
 
271 aa  171  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  39.61 
 
 
276 aa  171  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  37.36 
 
 
268 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  39.13 
 
 
293 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  41.84 
 
 
284 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  41.64 
 
 
265 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  40.38 
 
 
268 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  38.65 
 
 
273 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  36.98 
 
 
269 aa  169  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  48.57 
 
 
182 aa  168  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  40.24 
 
 
267 aa  168  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  40.73 
 
 
272 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  43.18 
 
 
215 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  41.24 
 
 
279 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  41.15 
 
 
268 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  41.67 
 
 
273 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  40.44 
 
 
270 aa  165  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  35.5 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  39.42 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  41.08 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  39.71 
 
 
280 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  37.5 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  38.62 
 
 
271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  37.74 
 
 
270 aa  162  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  39.13 
 
 
279 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  39.83 
 
 
269 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  38.1 
 
 
269 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  39.27 
 
 
263 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  38.02 
 
 
274 aa  158  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  38.59 
 
 
267 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  40.32 
 
 
278 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  36.99 
 
 
283 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  38.08 
 
 
283 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  36.73 
 
 
263 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  37.85 
 
 
277 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  39.84 
 
 
268 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  40.96 
 
 
267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  37.65 
 
 
268 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  38.4 
 
 
271 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  37.6 
 
 
302 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  38.96 
 
 
272 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  37.96 
 
 
275 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20220  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  37.45 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00509085  normal  0.22266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  39.92 
 
 
306 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  39.36 
 
 
323 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  39.51 
 
 
252 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0769  protein of unknown function DUF574  34.43 
 
 
295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  37.29 
 
 
279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11550  Protein of unknown function (DUF574)  37.18 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356734  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  35.61 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  37.5 
 
 
271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0528  protein of unknown function DUF574  36.44 
 
 
266 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253629  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  35.2 
 
 
234 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  36.29 
 
 
278 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08330  Protein of unknown function (DUF574)  35.95 
 
 
272 aa  135  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  37.82 
 
 
298 aa  136  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>