More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0860 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 298 aa  590  1e-168  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0801  periplasmic solute binding protein  34.7 
 
 		 267 aa  155  9e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0824  periplasmic solute binding protein  34.7 
 
 		 267 aa  155  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  34.11 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0433  periplasmic solute binding protein  35.05 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  32.79 
 
 		 292 aa  138  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  28.67 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  25.5 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  27.21 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  28.98 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  26.69 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  26.59 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  29.9 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  33.48 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  31.87 
 
 		 277 aa  108  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  31.62 
 
 		 317 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  24.76 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 		 285 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  27.8 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  25.68 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  26.43 
 
 		 290 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  24.43 
 
 		 310 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  25.55 
 
 		 293 aa  106  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  25.53 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  27.24 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  25.1 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  26.46 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  26.85 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  26.88 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  26 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  27.36 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  28.38 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  25.54 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  26.8 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  24.75 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  25.65 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  24.48 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  28.63 
 
 		 304 aa  96.3  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  24.04 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  28.89 
 
 		 293 aa  95.9  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  27.45 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.85 
 
 		 319 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  24.55 
 
 		 292 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  27.64 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000836  cation ABC transporter cation-binding protein  28.52 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  22.39 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  25.58 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  25.59 
 
 		 307 aa  92.4  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  25.65 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  26.85 
 
 		 299 aa  92.4  8e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06745  hypothetical protein  27.95 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  22.78 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  28.4 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  23.23 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  22.83 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  24.54 
 
 		 306 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  28.63 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  24.32 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  25.4 
 
 		 322 aa  86.7  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  22.89 
 
 		 311 aa  86.3  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  25.2 
 
 		 306 aa  86.3  7e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  25.2 
 
 		 310 aa  85.9  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  25.9 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  25.1 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  24.18 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  23.74 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  25.93 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  26.12 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  28.46 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  25.9 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.53 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  27.54 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.91 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  27.08 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.91 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.91 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0123  periplasmic solute binding protein  26.01 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  27.63 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.91 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.91 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6284  periplasmic solute binding protein  24.75 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.1 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  28.24 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  23.25 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.93 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  25.37 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  22.67 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  26.89 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  26.89 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  23.88 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  25.08 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  28.5 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  25.1 
 
 		 324 aa  79  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1951  periplasmic solute binding protein  26.1 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0524661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  30.12 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  21.45 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.81 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  22.73 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  27.31 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>