More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1188 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  100 
 
 
308 aa  624  1e-178  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  66.44 
 
 
296 aa  388  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  50.37 
 
 
293 aa  290  3e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  46.51 
 
 
303 aa  281  9e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  44.41 
 
 
308 aa  246  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1279  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  38.31 
 
 
297 aa  218  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395362  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  40.84 
 
 
320 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  40.46 
 
 
320 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  40.46 
 
 
393 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  40.46 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  40.46 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  40.46 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  40.46 
 
 
291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  38.93 
 
 
330 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  38.22 
 
 
322 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  39.84 
 
 
333 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  38.78 
 
 
303 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  38.78 
 
 
303 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  37.6 
 
 
313 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  38.78 
 
 
303 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  36.43 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  39.22 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  35.31 
 
 
309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  39.37 
 
 
304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  34.48 
 
 
312 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1958  periplasmic solute binding protein  29.19 
 
 
297 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0602  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  31.25 
 
 
294 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2086  periplasmic solute binding protein  31.38 
 
 
330 aa  165  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0292  periplasmic solute binding protein  32.91 
 
 
329 aa  165  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0754  periplasmic solute binding protein  30.9 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2479  periplasmic solute binding protein  33.84 
 
 
324 aa  159  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3195  periplasmic solute binding protein  32.5 
 
 
309 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0732077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0986  periplasmic solute binding protein  31.1 
 
 
312 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0747  Mn2+/Zn2+ ABC transporter periplasmic protein  30.53 
 
 
398 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1454  periplasmic solute binding protein  27.45 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2376  periplasmic solute binding protein  31.08 
 
 
328 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000812872 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2369  periplasmic solute binding protein  27.64 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00739211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0352  periplasmic solute binding protein  30.17 
 
 
296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2641  periplasmic solute binding protein  28.84 
 
 
321 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0883  metal ion ABC transporter periplasmic protein  30.5 
 
 
307 aa  132  9e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1169  periplasmic solute binding protein  26.69 
 
 
317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.693162  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5320  periplasmic solute binding protein  24.48 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.723333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0239  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 
310 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35300  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.47 
 
 
301 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  26.34 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5104  periplasmic solute binding protein  28.31 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.244188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4719  periplasmic solute binding protein  28.31 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4805  periplasmic solute binding protein  28.31 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457429  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12096  hypothetical protein  26.94 
 
 
511 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000121377  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0611  periplasmic solute binding protein  30.04 
 
 
298 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0599  periplasmic solute binding family protein  23.47 
 
 
350 aa  101  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  25.09 
 
 
293 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  27.98 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  24.64 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  26.02 
 
 
304 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  25.65 
 
 
304 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  25.94 
 
 
294 aa  85.5  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  24.22 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  24.68 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  25.58 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  25 
 
 
304 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  28.02 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  25.3 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1248  periplasmic solute binding protein  28.98 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  28.52 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  26.98 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  26.09 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  22.57 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0249  periplasmic solute binding protein  25.33 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.746971  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  24.73 
 
 
322 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  25.09 
 
 
310 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  25.94 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  24.54 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  24.36 
 
 
322 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  25.19 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  24.22 
 
 
311 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  24.35 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  24.8 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  25.29 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  25.85 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  24.11 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  22.57 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  20.85 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  22.91 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  25.19 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  23.81 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  27.46 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  23.66 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  26.64 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  27.05 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  24.35 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  24.47 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  27.05 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1388  periplasmic solute binding protein  22.69 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  0.503002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  24.79 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  23.48 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  26.85 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  22.38 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  22.38 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0700149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>