More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0787 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 317 aa  644    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  51.63 
 
 		 314 aa  317  1e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  42.19 
 
 		 317 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  41.67 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  41.24 
 
 		 341 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  39.26 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  37.77 
 
 		 354 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 		 342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  37.05 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  37.05 
 
 		 357 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  34.59 
 
 		 341 aa  175  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  34.91 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  33.94 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  36.76 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  32.07 
 
 		 374 aa  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  34.18 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  35.19 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  33.45 
 
 		 346 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  35.05 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  31.23 
 
 		 352 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  29.02 
 
 		 354 aa  153  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 		 351 aa  149  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 		 401 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  30.51 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 		 340 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.8 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  29.86 
 
 		 514 aa  88.2  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  29.89 
 
 		 512 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  34.35 
 
 		 541 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  29.38 
 
 		 332 aa  86.3  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 477 aa  83.6  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.82 
 
 		 473 aa  83.2  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  32.82 
 
 		 541 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  28.44 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  31.03 
 
 		 341 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  33.59 
 
 		 541 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  29.38 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  29.58 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  25.84 
 
 		 527 aa  82  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0175  hypothetical protein  30.64 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.46847  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  26.32 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  32.91 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  37.12 
 
 		 563 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  28.35 
 
 		 530 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  28.25 
 
 		 522 aa  79.3  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  23.99 
 
 		 564 aa  79  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  23.95 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  28.99 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  27.68 
 
 		 526 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0964  putative radical SAM protein  27.61 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2203  hypothetical protein  33.85 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 469 aa  76.3  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  28.16 
 
 		 526 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  26.8 
 
 		 510 aa  75.9  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10300  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.6 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  27.86 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  27.86 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  28.75 
 
 		 548 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  25.47 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  29.54 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  30.37 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1565  putative radical SAM protein  27.18 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.705687  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  35.11 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1179  putative radical SAM protein  29.63 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  28.99 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  23.56 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1137  putative radical SAM protein  28.89 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00496914  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  27.41 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  24.04 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  29.63 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  24.52 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  27.41 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  23.44 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  25 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  25 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1256  putative radical SAM protein  29.63 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0785555  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4646  hypothetical protein  25.97 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  25 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  25 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5001  hypothetical protein  25.97 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1223  putative radical SAM protein  25.46 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.784754  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  25.93 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  29.63 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  25 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  21.63 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  25 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1418  conserved hypothetical radical SAM protein  32.31 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4871  conserved hypothetical protein TIGR01212  25.32 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  26.12 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  24.04 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  24.04 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4481  Fe-S oxidoreductase  25.97 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  26.81 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  25.93 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4885  conserved hypothetical protein TIGR01212  25.97 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0370  putative radical SAM protein  27.06 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>