More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0652 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0652  signal peptidase I  100 
 
 		 295 aa  597  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1799  signal peptidase I  71.22 
 
 		 288 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0193448  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1220  signal peptidase I  53.82 
 
 		 306 aa  306  3e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000669884  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1235  signal peptidase I  53.49 
 
 		 306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000420804  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0326  signal peptidase I  42.81 
 
 		 321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0292  signal peptidase I  25.97 
 
 		 432 aa  87  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  29.51 
 
 		 276 aa  87.4  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  28.52 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  30.32 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0373  signal peptidase I  27.56 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.444718  hitchhiker  0.000795915 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  28.57 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  28.3 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  28.84 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  26.67 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  25.94 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  29.56 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  29.69 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  25.48 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  26.9 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  34.35 
 
 		 190 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  26.9 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  26.12 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  27.68 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  28.4 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  29.52 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  27.1 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  25.76 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1211  Signal peptidase I  25.28 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0257047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  26.07 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  26.77 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  30.12 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  26.9 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  24.5 
 
 		 248 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  24.5 
 
 		 248 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  25.38 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1241  signal peptidase I  26.37 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.824327  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  27.52 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  31.03 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  27.52 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  27.52 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  27.13 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  31.25 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  26.39 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  27.9 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  27.13 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  28.51 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  27.13 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  25 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  26.03 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  26.37 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  31.48 
 
 		 197 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  27.52 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  26.15 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  26.15 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  26.21 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  26.15 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  26.15 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  28.57 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  26.21 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  26.15 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0365  peptidase S26A, signal peptidase I  22.91 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  27.54 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  26.15 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  26.15 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  23.29 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  25 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  31.54 
 
 		 190 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  25.87 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  25.1 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  26.15 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  32.31 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  24.7 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  24.3 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  26.35 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  28.98 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  28.98 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  28.98 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  28.98 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  25.17 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  28.98 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  28.98 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  28.98 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  27.41 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  24.71 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  24.83 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  24.91 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  31.45 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  28.08 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  26.29 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0331  signal peptidase I  23.27 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  32.06 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  25.17 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  25.61 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  24.21 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  28.26 
 
 		 184 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  26.69 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  26.57 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  25.29 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  30.56 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  29.01 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>