More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0096 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 141 aa  282  9e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  59.15 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  58.45 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  50.7 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  35.77 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  36.64 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  30.43 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  35.71 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  34.09 
 
 		 138 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  36.64 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  34.48 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  34.48 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  38.46 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  35.77 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  34.53 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  30.94 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  41.05 
 
 		 166 aa  89  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  36.36 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  36.64 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  34.85 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  45.35 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  36.19 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  43.82 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  37.12 
 
 		 163 aa  87.8  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  43.82 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  43.82 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  32.17 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 134 aa  87.8  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  36.3 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  34.35 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  32.59 
 
 		 140 aa  87  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  35.94 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  30.37 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  36.15 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  34.59 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  37.12 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  36.64 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  35.16 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  32.31 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 163 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  45.12 
 
 		 154 aa  84.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  30.37 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  33.1 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  36.36 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  32.26 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  33.61 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  31.75 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  32.52 
 
 		 165 aa  84.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  31.85 
 
 		 151 aa  84.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  36.5 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  43.82 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  41.86 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1002  NusB antitermination factor  29.93 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  30.08 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  33.85 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  27.61 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  34.09 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  33.85 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  33.85 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  33.85 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  35.94 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  34.85 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  38.58 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  30.71 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  41.18 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  28.79 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  37.8 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0422  hypothetical protein  34.71 
 
 		 378 aa  80.5  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  37.8 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  29.85 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01422  transcription antitermination protein NusB  35.38 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0163631  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  34.38 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  37.8 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  37.8 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  37.8 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  34.38 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  37.8 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  34.38 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  37.8 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  30.37 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  34.38 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  34.38 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  37.8 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  34.62 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  37.01 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  30.83 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  41.46 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  36.76 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  30.08 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0603  transcription antitermination protein NusB  32.61 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.016248  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  35.82 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  32.58 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  28.91 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>