More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4124 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4124  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  100 
 
 
378 aa  781    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2754  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  68.6 
 
 
387 aa  551  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2274  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  53.17 
 
 
387 aa  438  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.643103  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2550  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  53.33 
 
 
384 aa  415  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000605815  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3487  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  51.85 
 
 
389 aa  415  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2755  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  51.59 
 
 
383 aa  411  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.353022  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0305  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  51.99 
 
 
385 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4992  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  51.72 
 
 
386 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329749 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4123  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  50.26 
 
 
380 aa  363  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2496  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.8 
 
 
385 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0919487 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3593  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.45 
 
 
401 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717963  normal  0.229406 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5748  Formyl-CoA transferase  32.2 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5950  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.73 
 
 
386 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.12278  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4307  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.71 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0409  Formyl-CoA transferase  31.46 
 
 
396 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3480  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.76 
 
 
406 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8224  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.95 
 
 
396 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204991  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2158  Formyl-CoA transferase  31.36 
 
 
382 aa  192  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1225  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.15 
 
 
382 aa  192  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0131268  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2971  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.39 
 
 
419 aa  192  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315436  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6417  Formyl-CoA transferase  30.21 
 
 
418 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478883  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6129  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.21 
 
 
418 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4235  Alpha-methylacyl-CoA racemase  32.21 
 
 
393 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23160  predicted acyl-CoA transferase/carnitine dehydratase  33.77 
 
 
391 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3310  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.11 
 
 
422 aa  190  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2770  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.15 
 
 
410 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.68571  normal  0.674174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0034  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.27 
 
 
409 aa  188  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1831  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.99 
 
 
414 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00867179  normal  0.544825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1673  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.77 
 
 
406 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1080  Formyl-CoA transferase  30.33 
 
 
419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.982565  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4198  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.44 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0143  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.08 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4086  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.74 
 
 
390 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1429  CAIB/BAIF family protein  32.14 
 
 
422 aa  183  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.587908  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1038  Alpha-methylacyl-CoA racemase  29.97 
 
 
413 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000337447  normal  0.997405 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1077  CAIB/BAIF family protein  30.05 
 
 
420 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.674108  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2772  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.41 
 
 
399 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.350013  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5148  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.07 
 
 
407 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.392977  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3546  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.24 
 
 
411 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.906288  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1069  CaiB/BaiF family protein  30.67 
 
 
411 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5512  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.59 
 
 
403 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1258  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.58 
 
 
389 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.534766  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1855  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.38 
 
 
374 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415662  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02281  predicted CoA-transferase, NAD(P)-binding  30.47 
 
 
381 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1286  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.47 
 
 
381 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1298  hypothetical protein  30.47 
 
 
381 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2508  hypothetical protein  30.47 
 
 
381 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0122799  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02242  hypothetical protein  30.47 
 
 
381 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0247  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.19 
 
 
382 aa  179  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2740  hypothetical protein  30.47 
 
 
381 aa  179  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.382378  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3024  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.31 
 
 
416 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1886  Alpha-methylacyl-CoA racemase  29.43 
 
 
384 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.494704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0845  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.28 
 
 
431 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0637303 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2658  hypothetical protein  30.47 
 
 
381 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2521  hypothetical protein  30.21 
 
 
381 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2774  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.41 
 
 
381 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0458  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.83 
 
 
429 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0937  Formyl-CoA transferase  33.83 
 
 
407 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6581  acyl-CoA transferase/carnitine dehydratase  31.03 
 
 
385 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377335  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0204  Alpha-methylacyl-CoA racemase  28.93 
 
 
435 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491396  normal  0.983612 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0899  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.57 
 
 
407 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3734  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.08 
 
 
411 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3504  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.87 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.607597  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0880  Formyl-CoA transferase  28.39 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000116287  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1614  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.34 
 
 
406 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4099  acyl-CoA transferase/L-carnitine dehydratase CaiB  29.24 
 
 
411 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0342589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3015  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.83 
 
 
411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.472695  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2023  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.62 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.161113  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1193  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.45 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.058782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0244  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.79 
 
 
395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3771  Formyl-CoA transferase  28.83 
 
 
395 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.292423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2997  Alpha-methylacyl-CoA racemase  32.91 
 
 
419 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0442  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.06 
 
 
387 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0224  CAIB/BAIF family protein  29.55 
 
 
413 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0260  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.47 
 
 
392 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0702247 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0207  CAIB/BAIF family protein  29.55 
 
 
413 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1535  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.12 
 
 
412 aa  171  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0062  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.79 
 
 
402 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4272  Formyl-CoA transferase  28.46 
 
 
393 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.329604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1851  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.29 
 
 
404 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.990249  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6256  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.69 
 
 
406 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326861  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0819  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.43 
 
 
402 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.690639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4428  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.54 
 
 
407 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000922953  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2722  putative alpha-methylacyl-CoA racemase  31.23 
 
 
389 aa  170  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0206  Formyl-CoA transferase  28.27 
 
 
393 aa  170  4e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.640391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2013  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.23 
 
 
415 aa  170  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0642  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.25 
 
 
395 aa  170  4e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.440176  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4628  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.34 
 
 
415 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223388  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7130  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.62 
 
 
434 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4039  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.13 
 
 
407 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194141  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3791  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  26.4 
 
 
407 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2342  Alpha-methylacyl-CoA racemase  31.23 
 
 
391 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359975  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3300  acyl-CoA transferase/carnitine dehydratase  28.24 
 
 
389 aa  169  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.217224 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00058  CAIB/BAIF family enzyme (AFU_orthologue; AFUA_7G06520)  30.55 
 
 
416 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.790375  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6415  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.24 
 
 
394 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.835321 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1744  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.93 
 
 
402 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1756  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.41 
 
 
403 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0218449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5109  putative L-carnitine dehydrogenase  29.34 
 
 
408 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367445  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1398  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.64 
 
 
418 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.68 
 
 
415 aa  168  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>